针对您提出的“单位负责人发生事故是因为工作原因未经批准擅自离开如何处罚”的问题，这实际上涉及到了单位负责人在工作期间因个人行为（未经批准擅自离开）导致事故发生后的责任追究问题。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“未经批准擅自离开”这一具体情形，但我们可以根据相关法律法规和原则，结合事故的性质、后果以及负责人的责任来进行分析。

首先，需要明确的是，单位负责人在工作期间有义务遵守单位的规章制度，确保工作的正常进行和安全。如果负责人未经批准擅自离开，导致事故发生，那么这种行为很可能被视为对工作职责的忽视或违反，从而需要承担相应的责任。

在处罚方面，可能会涉及以下几个方面：

1. 行政处罚：

   • 如果事故未达到刑事犯罪的标准，但负责人存在违规行为（如未经批准擅自离开），单位或相关监管部门可能会对其给予行政处罚，如警告、罚款、通报批评等。这些处罚旨在纠正违规行为，防止类似事件再次发生。

2. 民事赔偿责任：

   • 如果事故造成了人员伤亡或财产损失，负责人可能需要承担民事赔偿责任。这包括赔偿受害者的医疗费用、财产损失等。民事赔偿责任的承担与事故的具体后果和负责人的责任大小密切相关。

3. 刑事责任：

   • 如果事故构成刑事犯罪（如交通肇事罪、重大责任事故罪等），且负责人对事故发生负有直接责任（如指使、强令他人违章操作导致事故发生后逃逸，或负责人本身就是肇事者且逃逸），那么负责人可能会被追究刑事责任。刑事责任的承担将依据相关法律法规和事故的具体性质、后果进行裁决。

4. 内部纪律处分：

   • 除了上述法律处罚外，单位还可能根据内部规章制度对负责人进行纪律处分，如降职、撤职、开除等。这些处分旨在维护单位的正常秩序和纪律。

综合判断与裁决： 对于单位负责人因工作原因未经批准擅自离开导致事故发生的处罚，将会依据事故的具体性质、引发的不良后果以及负责人的责任大小等多方面因素进行综合性的判断与裁决。如果负责人的行为严重违反了职业道德和社会责任感，且对公众利益造成了极大危害，那么其可能面临的处罚将会更加严厉。

因此，建议单位负责人在工作期间严格遵守规章制度，确保工作的正常进行和安全。如果因特殊原因需要离开工作岗位，应提前向单位申请并获得批准，以避免不必要的法律责任和风险。