公司未经许可使用了著作人的商标，应立即停止使用，并与著作人协商处理此事，必要时承担侵权责任。以下是对此问题的详细分析：

一. 分析公司使用著作人商标的法律性质

1. 商标权的独占性：根据《商标法》第三条，商标注册人享有商标专用权，受法律保护。这意味着商标权人对其商标具有独占使用的权利，未经许可，他人不得擅自使用。
2. 侵权行为的认定：根据《商标法》第五十七条，未经商标注册人的许可，在同一种商品或者类似商品上使用与其注册商标相同或者近似的商标，属于侵犯注册商标专用权的行为。公司未经著作人许可使用其商标，显然构成侵权。

二. 公司可能面临的法律后果

1. 民事责任：著作人有权要求公司停止侵权行为，赔偿因此遭受的损失。赔偿数额通常包括著作人因侵权所受到的损失、公司因侵权所获得的利益，或者由法院根据侵权行为的情节判决给予一定数额的赔偿。
2. 行政责任：工商行政管理部门有权对公司侵犯注册商标专用权的行为进行查处，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，并可处以罚款。
3. 刑事责任：如果公司侵犯商标权的行为情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

三. 公司的应对措施

1. 立即停止侵权行为：公司应立即停止使用著作人的商标，避免侵权行为的持续和扩大。
2. 与著作人协商处理：公司应主动与著作人联系，说明情况，并表达愿意承担相应责任的意愿。双方可以协商达成和解协议，如赔偿损失、消除影响等。
3. 加强商标管理：公司应加强对商标的管理和保护，建立健全商标使用和管理制度，避免类似侵权行为的再次发生。

四. 建议

1. 增强法律意识：公司应增强商标法律意识，尊重他人的商标权，合法合规地使用商标。
2. 进行商标检索：在使用商标前，公司应进行商标检索，确保所使用的商标未被他人注册或使用，避免侵权行为的发生。
3. 寻求专业法律建议：如果公司面临商标侵权纠纷，应及时寻求专业律师的法律建议，以便更好地维护自身权益。

我的观点：公司未经许可使用著作人的商标是严重的侵权行为，应立即停止并承担相应的法律责任。同时，公司应加强商标管理和保护，避免类似问题的再次发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。