针对您提出的“代持人把股份退股怎么处理”的问题，这是一个涉及公司法、股权代持协议以及实际操作流程的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、明确代持关系与法律地位
首先，需要确认代持人与实际控股人（即被代持人）之间的股权代持关系，这通常通过代持协议或相关证据来证明。明确这一关系是后续操作的基础，也是保障双方权益的关键。
二、协商退股事宜
与实际控股人协商：代持人应与实际控股人就退股事宜进行充分沟通，达成一致意见。这包括确定退股价格、支付方式、时间节点等关键要素。协商过程中，双方应秉持公平、公正的原则，确保退股条件合理且可行。
考虑其他股东意见：如果公司是有限责任公司，根据《公司法》规定，股东向股东以外的人转让股权时，应当经其他股东过半数同意。因此，在协商退股时，代持人也需要考虑其他股东的意见和态度，确保退股过程不会对公司造成不利影响。
三、办理退股手续
签订股权转让协议：在协商一致的基础上，代持人与实际控股人（或指定的受让人）应签订正式的股权转让协议，明确双方的权利和义务。协议中应详细列明转让的股份数量、价格、支付方式、违约责任等条款。
履行公司内部程序：按照公司章程和相关法律法规的要求，履行必要的内部审批和公告程序。例如，可能需要召开股东会会议，对股权转让事项进行表决和记录。这一步骤旨在确保公司内部对股权转让的认可和接受。
办理工商变更登记：完成股权转让后，代持人应及时向公司登记机关申请办理工商变更登记手续，将代持的股份变更至实际控股人或指定的受让人名下。这一步骤是法律上认可和保护股权转让的关键，也是确保公司股权结构清晰透明的重要措施。
四、特殊情形处理
代持人不配合：如果代持人拒绝配合办理退股手续，实际控股人可以依据代持协议向法院提起诉讼，请求法院强制代持人履行协议义务。在此过程中，实际控股人需要提供充分的证据证明代持关系的存在以及代持人的违约行为。
公司回购或减资退出：在某些情况下，实际控股人也可以考虑与公司协商，由公司回购其持有的股权。但这需要符合公司章程和相关法律法规的规定，并且通常需要经过其他股东的同意。如果无法通过股权转让的方式实现退出，还可以考虑通过公司减资的方式退出，但需要按照《公司法》规定的程序进行。
五、注意事项
确保合法性：在整个退股过程中，必须确保所有操作都符合法律法规的规定，避免出现违法违规行为。这包括股权转让协议的签订、公司内部程序的履行以及工商变更登记的办理等。
保护商业秘密：在协商和办理退股手续的过程中，应注意保护公司的商业秘密和敏感信息，避免泄露给公司外部人员。这有助于维护公司的竞争力和市场地位。
妥善解决纠纷：如果在退股过程中出现纠纷或争议，应寻求专业律师的帮助，通过法律途径妥善解决。这有助于避免纠纷的扩大和恶化，保护双方的合法权益。
综上所述，代持人把股份退股的处理过程需要遵循法律法规的规定，确保操作的合法性和有效性。同时，也需要考虑公司内部程序和其他股东的意见，以维护公司的稳定运营和其他股东的合法权益。