违法分包被查处后，整改的核心在于停止违法行为、消除违法后果、完善合规管理，并主动配合行政机关的调查与处罚。具体整改步骤如下：

1. 立即停止违法分包行为

• 违法分包被查处后，首要任务是终止所有违法分包合同，避免违法行为持续或扩大。例如，若原承包人将工程分包给无资质的单位或个人，应立即解除分包合同，并由具备资质的主体重新承接工程。
• 若分包工程已部分完成，需评估已完成部分的质量与合规性，必要时进行返工或补救，确保工程整体符合法定标准。

2. 配合行政机关的调查与处罚

• 主动向查处部门（如住建部门、市场监管部门）提交相关材料，包括分包合同、资质证明、付款凭证等，说明违法分包的具体情况（如分包范围、分包方资质、分包比例等）。
• 接受行政机关的处罚决定（如罚款、停业整顿、降低资质等级等），并在规定期限内缴纳罚款、完成整改。若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，但在此期间仍需履行处罚决定中的整改义务。

3. 消除违法后果，修复工程与信用

• 工程修复：若违法分包导致工程质量问题（如分包方使用劣质材料、施工不规范），需委托有资质的检测机构对工程进行质量鉴定，并由原承包人或新分包方进行修复，确保工程符合设计要求与安全标准。
• 信用修复：违法分包行为可能被记入企业信用档案，影响后续投标与资质申请。需按行政机关要求完成整改后，申请信用修复（如提交整改报告、参加信用培训等），逐步恢复企业信用。

4. 完善内部合规管理

• 修订分包制度：制定或完善《分包管理办法》，明确分包范围、分包方资质要求、分包审批流程等，禁止将主体工程分包，限制专业工程分包比例。
• 加强资质审核：建立分包方资质审查机制，要求分包方提供营业执照、资质证书、安全生产许可证等原件，并核实其真实性、有效期及业绩。
• 强化合同管理：在分包合同中明确质量、安全、工期等责任条款，约定违约责任（如分包方违约时，承包人有权解除合同并索赔），并留存合同履行过程中的证据（如验收单、付款记录等）。

5. 培训与预防

• 组织企业管理人员、项目负责人参加法律培训，重点学习《建筑法》《招标投标法》《建设工程质量管理条例》中关于分包的规定，提高合规意识。
• 定期开展内部自查，重点检查分包合同备案、分包方资质、工程款支付等环节，及时发现并纠正潜在违法风险。

整改示例：某建筑公司因将主体工程分包给无资质个人被查处，整改时：

1. 立即解除分包合同，由公司自有队伍完成剩余工程；
   
2. 配合住建部门调查，提交分包合同、付款记录等材料，接受罚款并停业整顿1个月；
   
3. 委托检测机构对已完工部分进行质量鉴定，发现部分混凝土强度不达标，返工重做；
   
4. 修订《分包管理办法》，明确“主体工程不得分包，专业工程分包需经公司总经理审批”，并建立分包方资质库；
   
5. 组织全员参加“建设工程分包合规”培训，考核通过后方可上岗。

提示：违法分包整改需“标本兼治”，既要解决当前问题，也要从制度、管理层面预防再次发生。若对具体整改措施或法律责任有疑问，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供详细方案。