针对农民工工资账户名称过长的问题，可采取以下措施解决：

1. 向开户银行申请账户名称简化
   根据《人民币银行结算账户管理办法》相关规定，账户名称原则上应与单位公章、营业执照名称一致，但若因系统限制或实际使用需求导致名称过长，可向开户银行提交书面申请，说明名称过长对转账、支付等业务造成的不便，请求银行在系统中对账户名称进行简化处理（如使用简称）。银行在审核通过后，可在内部系统中标注简化名称，确保对外支付时名称一致。

2. 通过银行内部系统调整显示名称
   部分银行允许在网银、手机银行等电子渠道中自定义账户显示名称。用户可联系开户银行客服或前往柜台，申请将账户在电子系统中的显示名称调整为更简洁的形式（如“XX项目农民工工资专户”），而实际账户名称仍保持法定名称不变。此方式不影响账户法律属性及资金安全。

3. 在合同或协议中约定简称
   若账户名称过长影响合同、协议等法律文件的签署，可在相关文件中明确约定“本合同中所述‘XX项目农民工工资专用账户’指代开户名为‘XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX公司XX项目农民工工资专用账户’的银行账户”。根据《民法典》第四百六十六条，当事人对合同条款的理解有争议的，应按照合同相关条款或交易习惯确定，约定简称可避免歧义。

4. 法律风险提示
   需注意，账户名称的简化仅限于显示或内部使用，不得擅自变更法定账户名称，否则可能影响工资发放的合法性及税务、审计等监管要求。若因名称问题导致工资支付纠纷，用人单位需承担举证责任，证明简化名称与法定账户的对应关系。

建议：优先通过银行系统调整显示名称或申请内部简化，同时保留法定名称的完整记录。如有进一步疑问，可直接向我咨询农民工工资支付、账户管理等相关法律问题。