若公司被起诉且不希望一次性付清被诉讼金额，可考虑以下处理方式：

1. 与原告协商分期付款
   这是最直接且风险较低的方式。公司可主动联系原告（或其代理人），提出分期偿还的方案，并明确每期还款金额、时间及违约责任。若双方达成一致，可签订书面《还款协议》或《和解协议》，并提交法院备案。
   注意：需确保协议内容合法（如无高利贷、胁迫等情形），否则可能被法院认定无效。

2. 申请法院调解
   在诉讼过程中，公司可向法院申请调解，由法官或调解员主持双方协商。若原告同意分期还款，法院可出具《民事调解书》，明确还款计划及法律后果（如逾期可强制执行）。
   优势：调解书具有强制执行力，且调解过程可能简化诉讼程序，降低时间成本。

3. 提出执行和解（若已进入执行阶段）
   若法院已判决公司败诉并进入执行程序，公司仍可与原告协商执行和解，签订《执行和解协议》，约定分期履行。此时需注意：

   • 和解协议需经法院确认，否则原告可能恢复执行；
     
   • 若公司未按协议履行，原告可申请恢复原判决执行，并可能要求支付迟延履行利息。

4. 申请破产保护（极端情况）
   若公司资不抵债且无法通过其他方式解决债务，可依据《企业破产法》申请破产清算或重整。在破产程序中，债务需按法定顺序清偿，且可能通过重整计划实现分期偿还。
   风险：破产程序复杂，可能影响公司信用及经营，需谨慎评估。

风险提示与建议：

• 无论选择哪种方式，均需保留书面证据（如协议、沟通记录），避免口头约定；
  
• 分期还款期间，公司应优先履行与原告的协议，避免因其他债务导致资产被查封；
  
• 若原告拒绝协商，公司需积极应诉，争取通过法律程序（如抗辩、反诉）降低赔偿金额。

如有进一步疑问或需具体方案，可直接向我咨询。