核心结论：宅基地测绘发现部分为农用地时，需根据土地性质、规划用途及法律程序进行分类处理，具体分为以下三种情形：

1. 若宅基地审批时已包含农用地部分（合法占用）

• 处理原则：需确认是否已依法办理农用地转用审批手续。根据《土地管理法》第四十四条，建设占用农用地需经省级政府或国务院批准，并落实耕地占补平衡。
• 操作步骤：
  1. 核查审批文件：检查宅基地使用权证、规划许可证及农用地转用批文是否齐全；
  2. 补办手续：若未办理转用手续，需向县级自然资源部门申请补办，并缴纳相关费用；
  3. 合规使用：确保后续建设符合宅基地用途，不得擅自改变为经营性用途。

2. 若宅基地审批范围超出合法界限（违法占用）

• 处理原则：根据《土地管理法》第七十七条，未经批准占用农用地建房的，由县级以上政府责令退还土地，限期拆除或没收地上物。
• 操作步骤：
  1. 停止建设：立即停工并恢复土地原状；
  2. 协商整改：与村委会或自然资源部门协商，通过调整宅基地范围、置换土地等方式合规化；
  3. 接受处罚：若无法整改，需承担行政处罚（如罚款），并申请补办手续（若符合规划）。

3. 若测绘发现误差或历史遗留问题（权属争议）

• 处理原则：需通过土地确权程序明确权属，区分是测绘技术误差还是历史占用问题。
• 操作步骤：
  1. 申请复核：向县级自然资源部门申请测绘成果复核，确认土地性质；
  2. 确权登记：若为历史遗留问题（如早期无审批占用），可依据《确定土地所有权和使用权的若干规定》申请确权；
  3. 司法途径：若争议涉及第三方，可通过行政复议或民事诉讼解决。

关键风险提示

• 规划冲突：若农用地属于永久基本农田，则严禁占用，需重新选址；
• 时效限制：违法占用行为超过两年未发现的，行政处罚时效届满，但地上物可能仍需拆除；
• 补偿问题：若涉及征收，农用地补偿标准低于宅基地，需提前协商补偿方案。

建议：根据测绘报告和土地利用总体规划，优先通过合法程序调整宅基地范围；若存在违法情形，建议主动整改以降低法律风险。如有具体案例或文件，可进一步提供细节，我将为您定制解决方案。