关于回迁房协议能否办理租房补贴以及是否合法的问题，这确实是一个涉及多方面因素和地域差异性的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、回迁房协议与租房补贴的关系

首先，需要明确的是，回迁房协议本身并不能直接决定您是否能办理租房补贴。回迁房协议主要是用于确定您因拆迁而获得的回迁房权益和相关补偿事宜。而租房补贴则是根据当地的住房保障政策或相关规定来申请和发放的，它主要针对的是住房困难群体。

二、能否申请租房补贴的条件

1. 房屋状况：

   • 如果您的回迁房产权归属于您，且房屋状况良好，能够满足您家庭的居住需求，那么您通常是不符合租房补贴申请条件的。因为租房补贴政策的设计初衷是为了解决住房困难群体的居住问题。
   • 但是，如果您的回迁房存在严重质量问题，经相关部门鉴定确认不具备居住条件，且您家庭没有其他合适住房而需要租房居住，那么您可以向当地住房保障部门说明情况，并提供房屋质量鉴定报告等相关材料，尝试申请租房补贴。

2. 居住面积：

   • 部分地区对于住房困难的认定有明确的人均居住面积标准。如果您的回迁房面积过小，导致家庭人均居住面积低于当地规定的标准，并且您同时满足其他租房补贴申请条件（如收入水平等），那么您就有可能符合申请资格。

三、申请租房补贴的合法性

申请租房补贴的合法性主要取决于您是否满足当地住房保障部门制定的具体政策、申请条件及审核标准。只要您符合这些条件，并按照规定的程序进行申请，那么您的申请就是合法的。

四、地域差异与政策查询

由于各地关于租房补贴的政策规定存在较大差异，因此确定回迁房能否申请租房补贴的关键在于详细了解当地住房保障部门制定的具体政策。我建议您主动咨询当地的住房保障部门或查阅相关政策文件，以获取最准确的信息和指导。

五、结论

综上所述，回迁房协议本身并不能直接决定您是否能办理租房补贴。能否申请租房补贴取决于多种因素，包括房屋状况、居住面积以及当地的具体政策规定。在申请前，您务必详细了解并咨询当地住房保障部门的相关政策和要求，以确保申请的准确性和有效性。只要您符合当地政策规定的条件，并按照规定的程序进行申请，那么您的申请就是合法的。