民办非营利医疗机构未经民政登记，将面临一系列严重的法律后果，具体分析如下：
取缔与没收非法财产：
- 根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》的相关规定，未经登记而擅自以民办非企业单位（包括民办非营利医疗机构）名义进行活动的，将由登记管理机关（即民政部门）予以取缔，并没收其非法财产。这意味着，该医疗机构不仅无法继续合法运营，其所有非法所得的财产也将被政府没收。
刑事责任追究：
- 如果未经登记的民办非营利医疗机构在运营过程中造成了严重后果，如严重损害患者权益、引发社会不稳定因素等，那么相关责任人员可能构成犯罪，依法将被追究刑事责任。这包括但不限于罚款、有期徒刑等刑罚。
治安管理处罚：
- 对于尚不构成犯罪的未经登记民办非营利医疗机构，登记管理机关将依法给予治安管理处罚。这可能包括警告、罚款、拘留等措施，具体取决于违法行为的性质和严重程度。
法律建议：
- 对于民办非营利医疗机构而言，务必在运营前完成民政登记手续，确保合法合规运营。这不仅是遵守法律法规的基本要求，也是保障患者权益、维护社会稳定的重要举措。
- 如果已经存在未经登记而擅自运营的情况，应立即停止相关活动，并主动向民政部门说明情况，积极配合调查和处理工作。以避免更严重的法律后果。
后续行动指南：
- 如果您是民办非营利医疗机构的负责人或相关人员，且机构尚未完成民政登记，请尽快联系当地民政部门了解登记流程和要求，并按照规定完成登记手续。
- 如果您发现身边存在未经登记而擅自运营的民办非营利医疗机构，可以向当地民政部门或相关监管部门举报，以维护社会秩序和患者权益。
在处理此类法律问题时，请务必保持谨慎和理性。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会尽力为您提供专业的法律意见和支持。