病假期间用人单位扣工资是不合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定
根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》以及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，职工在患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内，用人单位应当按照有关规定支付其病假工资或疾病救济费。这些规定明确指出，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。
二、病假工资的计算
病假工资的计算通常遵循以下原则：
工资计算基数：
- 有约定的，按不低于劳动合同约定的劳动者本人所在岗位（职位）相对应的工资标准确定。
- 集体合同（工资集体协议）确定的标准高于劳动合同约定标准的，按集体合同（工资集体协议）标准确定。
- 劳动合同、集体合同均未约定的，可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，协商结果应签订工资集体协议。
- 用人单位与劳动者无任何约定的，假期工资的计算基数统一按劳动者本人所在岗位（职位）正常出勤的月工资的70%确定。
病假工资系数：
- 病假工资的系数与职工病假期限以及工龄的长短相对应。一般来说，期限越长，工龄越短，系数越小。
- 具体系数根据连续休假时间和连续工龄的不同而有所差异，如连续休假在6个月以内的，连续工龄不满2年，病假工资的系数为本人工资的60%；满2年不满4年，病假工资的系数为本人工资的70%；以此类推。
计算公式：
- 病假工资 = （月工资计算基数 ÷ 当月计薪日）× 病假工资比例 × 病假天数
- 其中，计薪日是指国家规定的制度工作日加法定休假日。
三、特殊情况
- 如果劳动者未按公司规章制度请假，或提供虚假病假证明，用人单位按照规章制度扣工资，可能具有合法性。比如公司明确规定，未提前请假或无法提供有效病假证明的按旷工处理，旷工期间可不支付工资。
- 若劳动合同、集体合同或者用人单位依法制定的规章制度另有高于法定标准的病假工资支付规定，应按照该规定执行。
四、建议与后果
- 对于劳动者：如果遇到用人单位在病假期间扣工资的情况，首先应当与用人单位进行协商，要求其按照法律规定支付病假工资。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。
- 对于用人单位：应当严格遵守相关法律法规，按照规定支付劳动者的病假工资。如果违反规定扣工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，以及劳动者的法律诉讼，从而承担不必要的法律责任和经济损失。
综上所述，病假期间用人单位扣工资是不合法的。如果遇到此类情况，劳动者应当积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。