集体土地未经法定程序变为国有土地是不合法的。以下从多个角度进行详细分析：

一、集体土地变为国有土地的合法途径

1. 征收：

   • 这是集体土地变为国有土地的主要途径。根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，市、县人民政府土地行政主管部门负责拟定征收土地方案，包括范围、面积、用途等，并逐级上报至省级人民政府或国务院审批。经批准后，由市、县人民政府公告征收土地方案，并组织实施征地补偿安置工作。补偿通常涵盖土地补偿费、安置补助费及地上附着物和青苗的补偿费等。

2. 城市规划区内集体土地依法转为国有：

   • 在土地利用总体规划确定的城市和村庄、集镇建设用地规模范围内，符合条件的农用地可按年度计划分批次转为建设用地，由原批准土地利用总体规划的机关或其授权的机关批准。这一过程中，集体土地可以依法转为国有土地。

3. 集体土地所有者申请：

   • 在特定情形下，如出于公共利益考虑，集体土地所有者可主动申请将土地转为国有。但此过程需经过严格的审批程序，确保符合法律法规和政策要求。

二、未经法定程序变更土地性质的后果

• 缺乏法律依据：集体土地未经征收等法定程序，仅通过村民代表大会决议或其他方式将其确认为国有土地，并核发国有土地使用权证，是缺乏法律依据的。这种做法可能被法院判决确认违法，如最高人民法院作出的(2019)行申1065号再审审查与审判监督行政裁定就明确了这一点。

• 侵害集体合法财产权利：对于已经明确权属乃至登记发证的集体土地，不能直接通过政府确权方式改变为国有土地。否则，就是对集体合法财产权利的侵害，可能引发法律纠纷和赔偿问题。

• 不得登记发证：根据相关规定，借户籍管理制度改革或者擅自通过“村改居”等方式非经法定征收程序将农民集体所有土地转为国有土地的，不得登记发证。造成严重后果的，还要严肃追究有关人员责任。

三、建议与注意事项

• 严格遵守法定程序：无论是政府还是集体土地所有者，都应严格遵守法定程序，确保集体土地变为国有土地的过程合法合规。

• 加强法律意识：相关各方应加强法律意识，了解并遵守相关法律法规和政策要求，避免因违法操作而引发法律纠纷和损失。

• 及时咨询专业律师：在涉及集体土地变为国有土地的问题上，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律意见和建议。

综上所述，集体土地未经法定程序变为国有土地是不合法的。相关各方应严格遵守法定程序，确保土地性质变更的合法性和合规性。