结论：交通事故人伤协议赔付五年后，一般情况下，以重大误解为由起诉撤销协议的撤销权已经灭失。但具体还需结合签订协议时的具体情况及撤销权行使期限的法律规定来综合判断。

分析：

1. 撤销权的行使期限：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人自知道或应当知道撤销事由之日起一年内未行使撤销权的，撤销权消灭。对于因重大误解而签订的协议，当事人自知道或应当知道撤销事由之日起九十日内未行使撤销权的，撤销权同样消灭。
   • 特别地，自民事法律行为（即签订赔偿协议）发生之日起五年内未行使撤销权的，撤销权最终消灭。这一规定是撤销权行使的最长期限限制，也被称为“除斥期间”。

2. 五年期限的适用：

   • 在您所描述的情况中，交通事故人伤协议赔付已经过去五年。这意味着，从签订协议之日起算，五年的除斥期间已经届满。
   • 除非存在特殊情况（如当事人一直不知晓撤销事由，且该不知晓非因其自身过错导致），否则在五年期限届满后，当事人再以重大误解为由起诉撤销协议的，法院通常不会支持。

3. 重大误解的认定：

   • 重大误解通常指的是当事人在签订协议时，对事故性质、伤情、赔偿标的等存在错误认识，导致行为后果与真实意愿相悖，并造成较大损失。
   • 然而，即使存在重大误解，如果撤销权已经在五年期限内未行使而消灭，那么当事人也无法再以此为由起诉撤销协议。

4. 实际操作建议：

   • 鉴于撤销权已经灭失，当事人可能需要考虑其他途径来解决可能存在的争议或问题，如通过协商、调解或另行起诉要求赔偿等。
   • 如果当事人认为协议存在欺诈、胁迫等其他可撤销情形，且这些情形的发现时间在五年期限内，那么可以尝试以此为由起诉撤销协议。但需要注意的是，这同样需要满足法律规定的撤销条件，并在法定期限内行使撤销权。

特别提醒：法律问题具有复杂性和个体差异性，每个案件的具体情况都可能影响法律适用和判决结果。因此，如果您对交通事故人伤协议赔付或撤销权行使有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供全面、准确且具有针对性的法律意见。