企业一般不能直接通过仲裁申请与员工解除劳动关系，但在特定情形下，企业可依法解除劳动关系，若员工对此有异议，则可能引发仲裁程序。以下是对此问题的详细分析：

一、企业不能直接通过仲裁解除劳动关系

仲裁是解决劳动争议的一种方式，但它并不是企业单方面解除劳动关系的手段。企业不能直接向劳动争议仲裁委员会提出申请，要求仲裁解除与员工的劳动关系。劳动关系的解除需要基于法定的理由和程序，而不是通过仲裁来直接实现。

二、企业可依法解除劳动关系的情形

尽管企业不能直接通过仲裁解除劳动关系，但在某些法定情形下，企业有权依法解除与员工的劳动关系。这些情形包括但不限于：

1. 员工严重违反规章制度：如果员工严重违反了企业的规章制度，且这些规章制度是合法、合理并经过公示的，企业有权依法解除与该员工的劳动关系。
2. 员工不能胜任工作：经过培训或者调整工作岗位后，员工仍不能胜任工作的，企业可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
3. 客观情况发生重大变化：劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，且企业与员工未能就变更劳动合同内容达成协议的，企业可以解除劳动合同。
4. 经济性裁员：在企业生产经营发生严重困难等情况下，企业可以进行经济性裁员，但需要遵循法定的程序和条件。

三、员工异议可能引发的仲裁程序

如果企业依法解除了与员工的劳动关系，但员工对此有异议，认为企业的解除行为违法或不当，员工有权向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。在这种情况下，仲裁程序将围绕企业解除劳动关系的合法性、合理性以及员工的权益保护等问题进行审理和裁决。

四、法律建议

1. 企业应依法行事：企业在解除与员工的劳动关系时，必须严格遵守法律法规的规定，确保解除行为的合法性和合理性。否则，企业可能面临法律风险和赔偿责任。
2. 员工应了解自身权益：员工应了解自己的劳动权益和法律法规的规定，以便在劳动关系解除时能够维护自己的合法权益。如果员工对企业的解除行为有异议，应及时向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。
3. 双方应积极协商：在劳动关系解除过程中，企业和员工应积极协商，寻求和解的可能性。通过协商达成一致意见，可以避免仲裁程序的繁琐和不确定性，同时也有助于维护双方的和谐关系。

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