关于员工请假扣款是否应算周六日的问题，结论需分情况讨论：

1. 若公司规章制度或劳动合同明确规定周六日为休息日且不计入请假扣款天数
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位应依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。若公司制度或合同中明确周六日为带薪休息日（即不扣工资），则员工请假时，周六日不应计入扣款天数。例如，员工周一至周五请假3天，周六日正常休息，则仅按3天实际请假天数扣款。

2. 若公司规章制度或劳动合同未明确周六日性质，或规定周六日为工作日

   • 情况一：周六日为正常工作日
     若公司因业务需要安排周六日上班（如单休制），且未支付加班费或未调休，则周六日属于实际工作天数。此时，员工请假需按实际出勤天数计算扣款，周六日请假同样扣款。例如，员工单休制下周一至周六工作，周日休息，若周三至周五请假3天，则按3天扣款；若周六也请假，则需额外扣1天。
     
   • 情况二：周六日为休息日但未明确扣款规则
     若公司未明确周六日是否扣款，实践中可能引发争议。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者原因造成单位损失的，单位可按合同约定要求赔偿，但扣款不得超过当月工资的20%。若公司无明确规定，擅自将周六日计入扣款天数可能涉嫌违法，员工可主张按实际工作日扣款。

3. 法律建议

   • 员工角度：
     
     1. 核查劳动合同、员工手册或公司制度中关于“请假扣款”“休息日”的条款；
        
     2. 若公司违规扣款，可先协商，协商不成可向劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁；
        
     3. 保留请假记录、工资条等证据，以便维权。
        
   • 公司角度：
     
     1. 制定明确的请假制度，区分工作日与休息日，并写入劳动合同或员工手册；
        
     2. 若周六日为工作日，需支付加班费或安排调休，避免因扣款问题引发纠纷；
        
     3. 扣款时需符合《工资支付暂行规定》，不得超额扣款。

总结：周六日是否计入请假扣款天数，关键看公司制度或合同是否明确其性质。若为休息日且未约定扣款，则不计入；若为工作日或约定扣款，则需计入。建议双方提前明确规则，避免争议。如有具体案例或合同条款需分析，可进一步向我咨询。