仅持有法院判决书并不一定可以直接进行厂房交易。厂房作为不动产，其交易需遵循严格的法律程序和规定。以下是对此问题的详细分析：
一、判决书内容对交易的影响
若判决书涉及房产权属变更：
- 如果法院判决书明确涉及了厂房的权属变更，即判决了厂房的所有权或使用权归属，且该判决已经生效，那么在办理房产交易手续时，相关部门可能会认可该判决书的效力。
- 在此情况下，若满足其他法定条件（如缴纳相关税费、完成产权过户登记等），则可以进行厂房交易。
若判决书未涉及房产权属变更：
- 如果法院判决书并未明确涉及厂房的权属变更，或者判决内容与房产交易无直接关联，那么该判决书可能无法直接作为房产交易的依据。
- 在此情况下，若要进行厂房交易，仍需按照正常的房产交易程序进行，包括签订买卖合同、缴纳税费、完成产权过户登记等。
二、其他限制条件
判决书规定的后续处理：
- 即使判决书涉及了房产权属变更，但如果判决中规定了需在一定期限内进行后续处理（如办理产权过户登记、缴纳税费等），则需在规定期限内完成相关手续，否则可能无法进行房产交易。
当地房产交易规定：
- 不同地区的房产交易规定可能存在差异。因此，在进行厂房交易前，需了解并遵守当地的相关规定。
- 例如，某些地区可能要求提供额外的证明材料或进行特定的审批程序。
三、法律建议
仔细审查判决书内容：
- 在进行厂房交易前，务必仔细审查法院判决书的内容，确保其明确涉及了房产权属变更，并了解判决中规定的后续处理要求。
咨询当地房产交易部门：
- 由于不同地区的房产交易规定可能存在差异，建议在进行厂房交易前咨询当地房产交易部门，了解具体的交易程序和要求。
寻求专业法律帮助：
- 如果对法院判决书的内容或房产交易程序存在疑问，建议寻求专业律师的帮助，以确保交易的合法性和有效性。
如有任何关于厂房交易或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。