若双方员工均使用假章签订合同并因此引发问题，首先需明确的是，此类行为可能涉及合同欺诈或伪造公司印章等违法行为，将面临严重的法律后果。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律后果
合同效力问题：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。因此，使用假章签订的合同，从法律上讲，可能被视为无效合同。
- 若合同被认定为无效，则合同中约定的权利义务对双方均不产生法律约束力，双方需根据各自过错承担相应的责任。
刑事责任问题：
- 伪造公司印章可能构成伪造公司印章罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。
- 若使用假章签订合同的行为还涉及其他犯罪，如诈骗罪等，则可能根据具体情节面临更严重的刑事处罚。
民事责任问题：
- 双方员工因使用假章签订合同而给公司或其他第三方造成损失的，需承担相应的民事赔偿责任。
- 公司可能因员工的行为而面临合同违约、声誉损害等风险，进而产生经济损失，这些损失可能由涉事员工承担。
二、应对措施
立即停止使用假章：
- 一旦发现使用假章签订合同的行为，应立即停止，并采取措施防止损失进一步扩大。
收集证据：
- 收集与假章使用相关的所有证据，包括合同文本、假章样本、使用记录等，以便后续维权或应对法律调查。
内部调查与处理：
- 公司应开展内部调查，查明假章使用的具体情况、涉事人员及责任划分。
- 根据调查结果，对涉事员工进行相应的纪律处分或法律追责。
法律维权：
- 若因使用假章签订合同而遭受损失，公司可依法向涉事员工或其他责任方提起民事诉讼，要求赔偿损失。
- 若发现涉事员工的行为涉嫌犯罪，公司应及时向公安机关报案，由司法机关依法追究其刑事责任。
三、预防措施
加强印章管理：
- 公司应建立健全印章管理制度，明确印章的保管、使用、审批等流程，防止印章被滥用或盗用。
提高员工法律意识：
- 加强对员工的法律培训，提高其法律意识和风险意识，避免因无知或疏忽而触犯法律。
建立合同审查机制：
- 在签订合同前，应建立严格的合同审查机制，对合同的真实性、合法性进行审查，防止因合同问题而引发法律风险。
针对您的情况，我建议立即采取措施停止使用假章，并收集相关证据以便后续维权。同时，公司应开展内部调查，查明责任并依法处理涉事员工。若因此遭受损失，可依法向责任方提起民事诉讼或向公安机关报案。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。