在非法进行的试管婴儿情况下，若女方起诉男方，男方一般不能无正当理由拒绝配合做亲子鉴定。以下从不同角度为您详细分析：
法律角度
亲子鉴定的法律依据：
- 在涉及亲子关系确认的诉讼中，如离婚诉讼、抚养权纠纷等，亲子鉴定是确认亲子关系的重要手段。根据相关法律规定及司法实践，若一方提出亲子鉴定申请，且该申请与案件处理有直接关联，另一方通常应配合进行亲子鉴定。
拒绝配合的法律后果：
- 如果男方无正当理由拒绝配合做亲子鉴定，法院可能会根据现有证据和法律规定，推定亲子关系存在或不存在，从而作出对男方不利的判决。例如，在抚养权纠纷中，若男方拒绝配合亲子鉴定，且无法提供其他证据证明自己与孩子无亲子关系，法院可能会认定男方为孩子的生物学父亲，并据此作出抚养权判决。
实际情况角度
非法试管婴儿的特殊性：
- 非法进行的试管婴儿可能涉及违反计划生育政策、非法行医等问题。然而，这些违法性并不直接影响亲子关系的确认。无论试管婴儿是否合法，亲子关系的确认都应遵循法律规定的程序和原则。
男方的配合义务：
- 在涉及亲子关系确认的诉讼中，男方作为当事人之一，有义务配合法院进行亲子鉴定。这是为了保障诉讼的公正性和效率，确保案件能够得到正确处理。如果男方拒绝配合，可能会被视为妨碍诉讼行为，受到法律的制裁。
建议与措施
积极配合亲子鉴定：
- 如果男方被要求配合做亲子鉴定，建议积极配合，以避免不必要的法律纠纷和负面后果。通过亲子鉴定，可以明确亲子关系，为案件的公正处理提供有力证据。
寻求法律帮助：
- 如果男方对亲子鉴定有异议或担心鉴定结果对自己不利，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询和辩护服务，帮助男方维护自己的合法权益。
注意证据收集：
- 在涉及亲子关系确认的诉讼中，证据的收集至关重要。男方可以收集其他相关证据，如与孩子的相处记录、经济支持证明等，以证明自己与孩子的关系。这些证据可以在亲子鉴定无法进行或结果不明确时，为案件的公正处理提供有力支持。