若公司声称退回超发工资，但员工认为并未多发，可按以下思路处理：

1. 核查工资发放记录与合同约定
   员工应首先要求公司提供工资发放明细（包括基本工资、绩效、奖金、补贴等各项构成）及劳动合同中关于工资标准的条款。若公司无法提供完整记录，或发放金额与合同约定一致，则员工有权拒绝退回。
   法律依据：根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者姓名及签字，并保存两年以上备查。若公司未履行记录义务，需承担举证不利后果。

2. 区分“超发”与“合理调整”
   若公司主张“超发”系因财务错误（如重复发放、计算错误），员工需核实：

   • 是否实际收到多笔转账（可通过银行流水核对）；
     
   • 工资构成中是否存在临时性调整（如季度奖提前发放、税前税后计算差异等）。
     若确认无误：员工可要求公司出具书面说明，明确超发原因及金额，并保留证据以防后续纠纷。
     若存在争议：员工可主张公司未尽到审慎核对义务，要求通过劳动仲裁或诉讼解决。

3. 拒绝不合理扣款
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   若公司以“超发工资”为由直接扣款：

   • 需证明超发系员工过错导致（如虚假报销、恶意篡改数据等）；
     
   • 若无法证明，员工可主张公司行为违法，要求补发被扣工资。

4. 协商与维权路径

   • 协商：员工可要求公司通过内部申诉流程处理，或联合其他员工共同核实情况；
     
   • 投诉：向当地劳动监察大队举报公司违法扣款行为；
     
   • 仲裁/诉讼：若协商无果，可申请劳动仲裁，主张公司返还非法扣款或确认工资发放合法性。

建议行动步骤：

1. 立即核对银行流水与工资条；
   
2. 要求公司提供超发工资的详细计算依据；
   
3. 书面拒绝不合理扣款，并保留沟通记录；
   
4. 若公司坚持扣款，及时咨询律师启动法律程序。
   

如有进一步疑问，可直接向我提问，我将结合具体案情提供分析。