劳动部门的立案在符合一定条件下是可以撤销的。以下是对此问题的详细分析：

一、劳动部门立案后撤案的可能性

劳动部门（现更名为人力资源和社会保障局）在立案后，若双方达成符合法律要求的和解协议，且撤案行为不会损害公共利益或他人合法权益，劳动部门通常准许撤案。撤案需由申请方提交书面申请，明确阐述撤案原因及相关状况，劳动部门会对申请进行细致审查，以确保撤案行为的合法性与合理性。

二、劳动部门立案后撤案的法律条件

1. 自愿原则：撤案申请应基于申请方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫等违背申请方真实意思的情况。
2. 不损害公共利益与他人合法权益：撤案行为不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。
3. 法定情形：根据《劳动保障监察条例》和《关于实施〈劳动保障监察条例〉若干规定》，劳动保障行政部门在立案后经调查，发现存在违法事实不能成立、违法情节轻微且已改正、被调查用人单位依法宣告破产等法定情形时，可以撤销立案。

三、撤案的具体流程与注意事项

1. 提交书面申请：申请方需向劳动部门提交书面撤案申请，明确阐述撤案原因及相关状况。
2. 劳动部门审查：劳动部门会对撤案申请进行细致审查，以确保撤案行为的合法性与合理性。
3. 审查结果：若撤案申请符合规定，劳动部门会准许撤案；若不符合规定，劳动部门则可能不会予以批准。
4. 后续权益保障：即使撤案了，劳动者的权益诉求仍有可能通过其他合法途径解决。若在撤案过程中遇到阻碍，或对撤案后的权益保障有疑问，如后续若发现新的权益受损情况该如何处理等，可及时向劳动部门或专业律师咨询。

四、特殊情形下的撤案处理

• 涉及劳动争议仲裁立案后撤诉：根据《劳动人事争议仲裁办案规则》，申请人在仲裁处理结果作出前，可自行撤回仲裁申请。但撤回仲裁申请后又反悔的，除有正当理由外，仲裁委员会一般不再受理。
• 法院立案后的撤诉：在法院作出判决前，原告可申请撤诉，这是当事人对自身诉讼权利的处分。申请撤诉需符合基于真实意愿且不损害国家、集体和他人合法权益等条件。若法院认为撤诉符合法律规定，会作出准予撤诉的裁定。

建议：在申请撤案前，建议申请方充分了解撤案的法律后果与风险，并咨询专业律师的意见。同时，在撤案过程中，申请方应积极配合劳动部门的审查工作，以确保撤案行为的顺利进行。若您在此过程中遇到任何法律问题，可直接向我咨询。