员工手册不合法，即便员工签了字，其不合法部分也是无效的。具体分析如下：
一、签字的意义与限制
员工在员工手册上签字，通常意味着员工已知晓手册的内容。但这一签字行为，并不直接等同于认可手册内容的合法性。签字更多是一种确认知晓的方式，而非对内容合法性的背书。因此，如果员工手册中存在违反法律法规的条款，即便员工签了字，这些条款依然是不合法的，对员工不产生约束力。
二、合法有效的员工手册需满足的条件
制定程序合法：
- 企业在制定员工手册时，应遵循合法的程序。特别是涉及劳动者切身利益的规章制度，如劳动报酬、工作时间等，应经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。如果未经此程序制定，员工手册的相关条款可能因程序不合法而无效。
内容不违反法律法规：
- 员工手册的内容必须严格遵守国家法律、行政法规及政策规定。任何违反劳动法律法规或其他相关法律法规的条款，都是无效的。例如，规定员工加班无加班费且不得拒绝加班的条款，就是违法的，无效的。
公示或有效告知：
- 企业应将员工手册中的规章制度和重大事项决定进行公示，或以其他方式确保员工真正理解手册内容。简单的签字并不能完全证明员工已充分理解和接受手册内容。如果手册内容以员工不熟悉的语言编写，且未提供有效的翻译或解释，那么员工手册的效力可能会受到质疑。
三、不合法员工手册的法律后果及应对建议
部分条款无效：
- 如果员工手册中的某些条款违反法律法规的强制性规定，那么这些条款是无效的，但不影响手册其他合理条款的效力。例如，规定员工必须接受不合理的调岗或降薪，这样的条款就是无效的。
整体效力待定与可撤销：
- 若员工手册整体存在严重不合理、显失公平的情况，比如工作条件极其苛刻而薪酬极低等，员工可以在法定期限内，通过向劳动争议仲裁机构或法院申请撤销或变更。在未被撤销或变更前，已签订的手册在一定程度上仍具有形式上的效力，但员工有权要求修改不合理的部分。
可协商变更：
- 员工发现手册不合理后，可以与用人单位协商，要求对不合理的条款进行修改和完善。协商一致后，双方可以重新签订或补充协议，以确保员工手册合法合理且符合双方意愿。
建议：作为员工，在签署员工手册前，应仔细阅读其内容，了解自己的权益和义务。如有疑虑或发现违法条款，应及时向公司提出并要求修改，或直接向我咨询，以维护自己的合法权益。作为用人单位，应确保员工手册的内容合法、制定程序合规，并有效公示或告知员工，以避免不必要的法律纠纷。