当员工因重大疾病导致病假期满时，用人单位和员工都需要根据相关法律法规来妥善处理这一问题。以下是对此情况的详细解答：
一、员工工作能力评估
能从事原工作：
- 如果员工在病假期满后，身体状况有所恢复，能够继续从事原工作，那么员工应正常回到原工作岗位，用人单位也需按照劳动合同的约定，为员工安排工作任务并支付相应的劳动报酬。
不能从事原工作：
- 若员工因重大疾病影响，无法继续从事原工作，用人单位有责任为员工另行安排其他适合的工作岗位。
- 如果员工能够胜任新安排的工作，那么双方应按照新岗位的要求和待遇，继续履行劳动合同。
- 如果员工仍然无法胜任新安排的工作，用人单位则需要考虑进一步的措施。
二、延长医疗期与解除劳动合同
延长医疗期：
- 在某些情况下，用人单位可以考虑为员工延长医疗期，以便员工有更多的时间恢复健康。
解除劳动合同：
- 如果延长医疗期后，员工仍然无法从事原工作或新安排的工作，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条的规定，用人单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付一个月工资后，解除劳动合同。
- 在解除劳动合同前，用人单位应确保已履行了通知工会的义务，并按照单位内部交接程序办理了相关手续。
三、经济补偿与医疗补助费
经济补偿：
- 用人单位在解除劳动合同时，需向员工支付经济补偿。经济补偿的标准按照员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
医疗补助费：
- 除了经济补偿外，用人单位还应根据相关规定，向员工支付不低于六个月工资的医疗补助费。对于患重病和绝症的员工，医疗补助费还需相应增加。
四、劳动能力鉴定与特殊保护
劳动能力鉴定：
- 如果员工不能从事原工作也不能从事新安排的工作，可以由劳动鉴定委员会进行劳动能力鉴定。根据鉴定结果，被鉴定为一至四级的员工应退出劳动岗位，解除劳动关系，并享受相应的退休退职待遇；被鉴定为五至十级的员工，用人单位可以解除劳动合同，但需按规定支付经济补偿金和医疗补助费。
特殊保护：
- 对于存在特殊情况的员工，如疑似职业病、因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力、孕期、产期、哺乳期等，用人单位不得依据相关法律规定解除劳动合同，而应根据具体情况与员工协商解决。
五、争议解决途径
如果员工与用人单位就病假期满后的处理问题存在争议，双方可以通过协商、调解、仲裁、诉讼等途径来解决。首先尝试与用人单位沟通协商；协商不成可以向本单位劳动争议调解委员会等调解组织申请调解；调解不成或达成和解协议、调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
综上所述，当员工因重大疾病导致病假期满时，用人单位应严格遵循法律法规，确保员工的合法权益得到保障。同时，员工也应了解自己的权益和义务，积极与用人单位沟通协商，共同维护劳动关系的和谐稳定。