事业单位一般不能仅因员工2012年9月之前的吸毒记录和不起诉决定就对其进行处分，但需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

一、处分依据的合法性

1. 法律法规的时效性：

   • 事业单位对员工进行处分，必须依据现行有效的法律法规。对于员工过去的吸毒记录，如果当时并未被依法追究责任，且后续没有再次发生违法行为，那么事业单位不能仅凭此前的记录就进行处分。
   • 不起诉决定是司法机关对案件作出的法律结论，它表明员工在当时的案件中未被追究刑事责任。事业单位不能仅凭不起诉决定就认定员工有违法行为并对其进行处分。

2. 处分程序的合规性：

   • 事业单位对员工进行处分，必须遵循法定的程序，包括调查取证、听取员工陈述和申辩、作出处分决定等。如果处分程序不合法，那么处分决定可能被撤销。

二、吸毒记录与不起诉决定的具体影响

1. 吸毒记录：

   • 吸毒行为本身是违法的，但如果员工在2012年9月之前的吸毒行为已经得到了处理（如被公安机关处罚），且后续没有再次发生吸毒行为，那么这一记录不应成为事业单位对其进行处分的直接依据。
   • 如果员工在事业单位工作期间再次发生吸毒行为，那么事业单位可以依据相关规定对其进行处分。

2. 不起诉决定：

   • 不起诉决定意味着员工在当时的案件中未被追究刑事责任。这可能是因为证据不足、情节轻微或其他原因。事业单位不能仅凭不起诉决定就认定员工有罪或对其进行处分。
   • 如果不起诉决定是基于员工确实没有实施违法行为而作出的，那么事业单位更没有理由对其进行处分。

三、建议与措施

1. 核实情况：

   • 事业单位在考虑对员工进行处分前，应核实员工的吸毒记录和不起诉决定的具体情况，包括吸毒行为是否已经得到处理、不起诉决定的具体原因等。

2. 遵循程序：

   • 如果事业单位认为需要对员工进行处分，应遵循法定的程序进行，确保处分决定的合法性和合规性。

3. 保护员工权益：

   • 在处分过程中，事业单位应保护员工的合法权益，听取员工的陈述和申辩，确保处分决定的公正性和合理性。

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