土地租赁合同修改三次本身并不直接构成纠纷，是否构成纠纷取决于修改的内容、双方是否达成一致以及是否存在违约行为等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、合同修改的法律性质
合同修改的本质：合同修改是双方对原合同条款的变更或补充，是合同自由原则的体现。只要双方协商一致，且修改内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，修改就是有效的。
修改次数与纠纷的关系：合同修改的次数本身并不决定是否构成纠纷。关键在于每次修改是否都得到了双方的认可，以及修改后的合同是否得到了实际履行。如果双方对修改内容无异议，且按照修改后的合同履行，那么就不会产生纠纷。
二、可能构成纠纷的情形
修改内容存在争议：如果双方对修改的内容存在分歧，比如一方认为修改后的条款对其不利，或者认为修改超出了原合同的范畴，那么就可能引发纠纷。
未达成一致即修改：如果一方未经另一方同意，擅自修改合同内容，并试图强制对方履行修改后的合同，这就构成了违约行为，可能引发纠纷。
修改后未履行：即使双方对修改内容达成了一致，但如果修改后的合同条款未得到实际履行，比如一方未按约定支付租金或提供土地，那么也可能构成纠纷。
三、法律建议与操作指南
明确修改内容：在修改土地租赁合同时，双方应明确修改的具体内容，包括修改的条款、修改的原因以及修改后的效果等。这有助于避免后续因修改内容不明确而产生的争议。
协商一致并书面确认：修改合同应经过双方协商一致，并以书面形式进行确认。书面确认可以固定双方的权利义务，为后续可能出现的纠纷提供证据。
遵守法律法规：在修改合同时，双方应遵守相关法律法规的规定，确保修改内容合法有效。比如，修改后的租赁期限不得超过法定最长期限（根据《中华人民共和国民法典》第七百零五条，租赁期限不得超过二十年，超过部分无效）。
及时履行合同：修改后的合同条款应得到及时履行。如果一方未按约定履行合同义务，另一方有权要求其承担违约责任。
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