对于蓝牌非营运货车帮朋友拉树苗发生交通事故时商业险是否赔偿第三者的问题，结论是因具体情况而异，可能赔偿也可能不赔偿。以下是对此问题的详细分析：

1. 保险合同条款的约定：

   • 商业险的赔偿范围通常依据保险合同的约定。如果保险合同中明确规定了非营运车辆从事营运活动（如拉货）时不予赔偿，那么在此情况下，保险公司有权拒绝赔偿。
   • 因此，首先需要查阅保险合同的具体条款，特别是关于车辆使用性质、赔偿范围及免责条款的部分。

2. 车辆使用性质的界定：

   • 蓝牌非营运货车原本的设计和使用目的是为了满足个人或家庭的日常出行需求，而非进行商业营运。
   • 如果车辆实际被用于帮朋友拉树苗，这可能被视为改变了车辆的使用性质，即从事了营运活动。
   • 保险公司可能会因此认为车辆使用性质发生了改变，从而拒绝赔偿。

3. 保险公司的理赔政策：

   • 不同的保险公司可能有不同的理赔政策和解释。有些保险公司可能对车辆使用性质的改变持较为宽松的态度，只要车辆没有长期或频繁地从事营运活动，仍可能给予赔偿。
   • 因此，具体赔偿与否还需考虑保险公司的实际理赔政策。

4. 法律途径的解决：

   • 如果保险公司拒绝赔偿，且双方无法达成协商，被保险人可以通过法律途径来维护自己的权益。
   • 在此过程中，可能需要提供保险合同、事故证明、车辆使用性质的相关证据等材料，以支持自己的主张。

综上所述，蓝牌非营运货车帮朋友拉树苗发生交通事故时商业险是否赔偿第三者，取决于保险合同的约定、车辆使用性质的界定以及保险公司的理赔政策。因此，在发生事故后，建议被保险人及时查阅保险合同、咨询保险公司，并根据实际情况采取相应的法律措施来维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。