结论：物业保安巡逻岗被领导查岗时认定为离开岗位并罚款二百元是否合法，需根据具体情况判断，包括公司规章制度是否合法、员工是否确实违反规定以及罚款金额是否合理等。

分析：

1. 公司规章制度的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
   • 因此，如果公司要对员工进行罚款，首先必须确保其规章制度是合法制定的，且内容不违反法律法规的强制性规定。如果规章制度未经合法程序制定或内容违法，那么基于此的罚款就是不合法的。

2. 员工是否确实违反规定：

   • 即使公司的规章制度合法，也需要确认员工是否确实违反了规定。例如，如果保安在巡逻过程中因处理紧急情况而暂时离开岗位，且事后及时返回并说明了情况，那么将其认定为离开岗位并罚款可能就不合理。
   • 此外，查岗的方式和频率也应合理，不能过于频繁或采用不正当手段，以免侵犯员工的合法权益。

3. 罚款金额的合理性：

   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 虽然该条款主要针对的是因员工原因给公司造成经济损失的情况，但也可以作为参考来判断罚款金额是否合理。如果罚款金额过高，超出了员工能够承受的范围，或者与员工的过错程度不成比例，那么这样的罚款就是不合法的。

建议：

• 如果您认为公司的罚款行为不合法，首先可以与公司进行沟通协商，要求公司撤销不合理的罚款决定。
• 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，请求劳动监察部门介入调查并处理。
• 在处理过程中，建议您保留好相关证据，如公司规章制度、查岗记录、罚款通知等，以便在需要时提供证明。

后续行动：

• 在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，不要采取过激行为。
• 如果您对法律程序不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。