结论前置：针对两人合伙开店且投资额不同的情况，合同签订需重点明确出资比例、利润分配、亏损承担、决策机制及退出规则，以下为具体建议：

1. 明确出资比例与股权结构

• 核心条款：合同中应清晰记载双方的投资金额、占总投资的比例（如甲方出资60万元占60%，乙方出资40万元占40%），并明确该比例是否直接对应股权比例（即分红权、表决权比例）。
• 注意事项：若一方以技术、资源等非货币形式出资，需评估其价值并折算为等价出资额（例如设备估值20万元，则计入总投资），避免因出资形式不同导致权益争议。

2. 设计利润分配与亏损承担规则

• 利润分配：可按出资比例分配（如甲方60%、乙方40%），也可约定超额利润分配（如达到目标后，甲方分70%、乙方分30%）。
• 亏损承担：需明确亏损是否按出资比例分担，或约定一方承担上限（例如乙方最多承担亏损的30%，超出部分由甲方补足），但后者需谨慎设计以避免显失公平。
• 示例条款：“合伙期间，净利润按甲方60%、乙方40%分配；若发生亏损，双方按出资比例分担，但乙方承担亏损总额不超过其出资额的120%。”

3. 约定决策机制与日常管理

• 表决权分配：可按出资比例行使表决权（如重大事项需2/3以上表决权通过），或约定“一票否决权”（如涉及店铺转让需双方一致同意）。
• 职责分工：明确双方分工（如甲方负责财务，乙方负责运营），并约定未履行职责的违约责任（如未按时报账需支付违约金）。
• 示例条款：“日常经营由乙方负责，单笔支出超过5万元需甲方书面同意；每月10日前，乙方需向甲方提供财务报表。”

4. 设定退出与解散规则

• 退出条件：约定一方可退出的情形（如连续亏损6个月、一方丧失民事行为能力），并明确退出时资产评估方式（如聘请第三方机构估值）。
• 回购价格：可按出资额原价回购，或按退出时店铺净资产比例计算（如甲方退出时，店铺净资产为100万元，则甲方按60%比例获得60万元）。
• 解散清算：约定解散时资产分配顺序（先清偿债务，再按出资比例分配剩余资产）。

5. 其他必备条款

• 竞业限制：禁止一方在合伙期间或退出后一定期限内（如2年内）从事同类业务。
• 保密义务：要求双方对店铺财务数据、客户信息等保密。
• 争议解决：约定争议解决方式（如仲裁或诉讼）及管辖地（如店铺所在地法院）。

示例合同框架：

合伙协议
甲方（出资60万元，占60%）：_________
乙方（出资40万元，占40%）：_________
第一条 出资：双方于____年__月__日前足额出资。
第二条 利润分配：按出资比例分配，每月5日分配上月利润。
第三条 亏损承担：按出资比例分担，乙方承担不超过出资额120%的亏损。
第四条 决策：单笔支出超5万元需双方同意；重大事项（如转让）需一致同意。
第五条 退出：一方退出需提前30日通知，按退出时净资产比例结算。
第六条 争议解决：向店铺所在地法院起诉。

风险提示：若未明确约定上述条款，可能导致分红争议、管理混乱或退出时资产分配纠纷。建议根据实际情况调整条款，并由双方签字确认。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体条款设计。