两人离婚时，确实可以在协议中约定将两套房子分别给两个孩子。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律可行性

1. 协议内容合法性：根据相关法律法规，夫妻在离婚时，可以就子女抚养、财产分割等事项达成一致，并写入离婚协议书。因此，将两套房子分别给两个孩子的约定，只要内容是双方真实意思表示，且不违反法律法规，不损害国家、集体和他人合法权益，就是具有法律效力的。

2. 房屋产权变更：签订协议后，双方需要按照协议内容办理房屋产权变更手续，将房屋过户到孩子名下。这是确保协议得以实际履行的重要步骤。

二、实际操作建议

1. 明确协议条款：在离婚协议书中，应明确约定两套房子的具体归属，包括房屋地址、产权比例、过户时间等细节，以避免后续产生争议。

2. 考虑孩子利益：在约定房屋归属时，应充分考虑孩子的利益和成长需求。例如，可以根据孩子的年龄、性别、生活习惯等因素，合理分配房屋，确保孩子能够在一个稳定、舒适的环境中成长。

3. 办理相关手续：签订协议后，双方应及时办理房屋产权变更手续，包括签订房屋买卖合同（如果需要）、缴纳相关税费、办理过户登记等。这些手续是确保房屋产权顺利转移的关键。

三、可能面临的法律后果及应对措施

1. 一方反悔：如果一方在签订协议后反悔，拒绝履行协议内容，另一方有权依据离婚协议书，要求对方履行相关手续。如果协商无果，可以向法院提起诉讼，要求确认协议效力并强制执行。

2. 房屋产权纠纷：在办理房屋产权变更手续过程中，可能会遇到各种问题，如房屋存在抵押、查封等情况。此时，双方应积极配合解决，确保房屋产权能够顺利转移。如果无法解决，可以寻求法律帮助，通过诉讼等方式维护自己的合法权益。

四、特殊情况考虑

1. 孩子年龄因素：如果孩子年龄较小，可能无法直接管理房屋。此时，双方可以约定由一方或双方共同代为管理房屋，直至孩子达到法定年龄或具备管理能力。

2. 房屋使用安排：在约定房屋归属时，还可以考虑房屋的使用安排。例如，可以约定一方在特定时间内享有房屋的使用权，或者双方共同使用房屋等。这些安排应充分考虑孩子的实际需求和双方的实际情况。

总结与建议：将两套房子分别给两个孩子的约定在法律上是可行的，但需要确保协议内容合法、明确，并办理相关手续。在实际操作过程中，双方应充分考虑孩子的利益和成长需求，积极配合解决可能遇到的问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。