股东协议若由法人配偶签订，其效力需视具体情况而定，不能一概而论说有效或无效。以下从不同角度为您详细分析：

一、构成表见代理时，股东协议通常有效

表见代理是指虽无代理权，但因存在足以使相对人相信行为人有代理权的事实和理由，法律规定被代理人需对之负授权人责任的代理。在股东协议签订的场景中，如果法人配偶长期参与公司经营管理、对外以法人名义从事活动，且相对人基于合理信赖与之签订股东协议，那么此时该协议通常有效，法人需受协议约束。例如，法人配偶一直代表法人处理公司事务，且在公司内部及外部均有较高的知名度，相对人基于这种合理信赖与其签订了股东协议，那么该协议对法人具有法律效力。

二、未经法人授权且相对人明知时，协议效力存在争议

如果法人配偶签字未经法人授权，且相对人明知其无代理权仍签订股东协议，那么该协议的效力就存在争议。一般情况下，此协议对法人不发生效力，但相对人有理由相信其有代理权的除外。比如，法人明确告知相对人其配偶无权代表其签订任何协议，但相对人仍坚持与法人配偶签订股东协议，那么此时该协议对法人可能不产生法律效力。

三、法人明确禁止配偶对外代表时，协议可能无效

如果法人明确禁止配偶对外代表其签订任何协议，包括股东协议，而配偶擅自签字，那么该协议可能因缺乏有效授权而无效。这种情况下，法人配偶的行为属于无权代理，且法人并未对此进行追认，因此该协议对法人不产生法律效力。

法律建议

1. 明确授权范围：法人应明确其授权范围，避免出现模糊地带导致纠纷。如果法人希望配偶代表其签订股东协议，应出具明确的授权委托书。
2. 审查签字人身份：相对人在签订股东协议时，应仔细审查签字人的身份和代理权限，确保其有权代表法人签订协议。
3. 保留相关证据：各方在签订股东协议过程中，应保留好相关证据，如授权委托书、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的主张。

股东协议若由法人配偶签订，其效力需根据具体情况判断。如果您在此方面遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。