关于和政府合作三年本金能否退还的问题，这并非一个简单的是非题，而是需要依据具体的合同条款、合作性质以及相关法律法规来综合判断。以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 合同条款的约定：

   • 首先，您需要仔细审查与政府签订的合作合同。合同中通常会明确约定双方的权利义务，包括本金的投入、使用、退还等条款。
   • 如果合同中明确规定了本金的退还条件、时间和方式，那么双方应当按照合同约定执行。若政府未按照约定退还本金，您有权依据合同条款要求政府履行退还义务，甚至可以通过法律途径维护自己的权益。

2. 合作性质的影响：

   • 合作的性质也会影响本金的退还。例如，如果是政府主导的公益性项目，可能涉及财政资金的专项使用，本金的退还可能受到更为严格的限制。
   • 如果是商业性合作，双方更可能遵循市场规则和合同约定来处理本金的退还问题。

3. 相关法律法规的适用：

   • 在处理与政府合作的本金退还问题时，还需要考虑相关法律法规的适用。例如，《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，以及政府采购法、财政资金管理等相关法律法规。
   • 如果政府的行为违反了法律法规或合同约定，您有权依法要求政府承担相应的法律责任，包括退还本金。

4. 实际操作中的建议：

   • 在实际操作中，我建议您首先与政府进行友好协商，明确双方对本金的退还问题的立场和态度。
   • 如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，通过法律途径来维护自己的权益。
   • 同时，保留好所有与政府合作的证据材料，包括合同、付款凭证、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

总结与建议：

• 和政府合作三年本金能否退还，取决于合同条款的约定、合作性质的影响以及相关法律法规的适用。
• 我建议您首先审查合同条款，了解双方的权利义务；其次，考虑合作的性质，判断本金的退还可能受到的限制；最后，如果遇到问题，及时寻求法律援助或咨询专业律师。
• 如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。