关于药房限制买药个数是否合法的问题，这实际上取决于多种因素，包括药品的性质、相关法律法规以及药房的具体管理政策。

首先，从法律法规的角度来看，对于某些特殊药品，如含有可待因等成瘾性成分的药品，政府确实会实施严格的管控措施。例如，根据药剂及毒药条例，含可待因的咳药水只限于有注册药剂师监督的药房出售，且某些浓度的咳药水必须经医生处方才可购买。这些规定旨在防止药品滥用和非法流通，保障公众健康。

其次，对于慢性病患者等需要长期服药的人群，政府也出台了相关政策来规范药品的处方和购买。比如，根据国家卫生健康委、国家医保局联合发布的《关于印发长期处方管理规范(试行)的通知》，针对慢性病患者实施长期处方管理，医生会评估患者病情后开具不超过一定期限的药量，以确保患者的用药安全。

再者，药房作为药品的销售终端，也有责任和义务遵守相关法律法规，并根据自身情况制定合理的管理政策。这些政策可能包括限制某些药品的购买数量，以防止药品囤积、滥用或非法转售。

综合来看，药房限制买药个数并不一定是非法的。如果这种限制是基于法律法规的要求，或者是为了保障患者的用药安全和防止药品滥用而采取的合理措施，那么这种限制就是合法的。当然，如果药房的限制措施没有合法依据，或者过于苛刻以至于影响了患者的正常用药需求，那么患者可以通过合法途径进行投诉和维权。

最后，我想强调的是，无论是药房还是患者，都应该遵守相关法律法规，共同维护药品市场的秩序和公众的健康安全。如果您对药房的限制措施有疑问或不满，建议先与药房进行沟通协商，如果无法达成一致，可以向相关部门进行投诉或咨询。