针对将查封厂房出租并将出租收入汇入不明账户的行为，处理方式需结合法律责任、程序补救及风险防范综合分析，具体如下：

1. 法律责任认定：可能涉及多重违法

• 违反查封规定：根据《民事诉讼法》第114条，隐藏、转移、变卖、毁损已被查封、扣押的财产，法院可责令改正，处以罚款（个人10万元以下，单位5万-100万元）；情节严重构成犯罪的（如拒不执行判决裁定罪），可处3年以下有期徒刑、拘役或罚金。
• 非法出租责任：若厂房产权已因查封受限，出租行为可能违反《民法典》第724条（租赁物权属有争议导致合同无效），承租人可要求返还租金并赔偿损失；出租方可能需承担违约责任。
• 资金流向问题：将收入汇入不明账户可能涉及隐匿财产、逃避执行，若账户与被执行人无关，可能构成转移财产；若涉及洗钱，则触犯《刑法》第191条（最高可处5-10年有期徒刑）。

2. 紧急补救措施：降低法律风险

• 立即停止出租行为：避免继续产生违法收益，减少损失扩大。
• 追回出租收入：通过书面通知承租人暂停支付租金，并要求将后续款项汇入法院指定账户；若已汇入不明账户，需向法院说明情况，申请调查账户性质。
• 主动向法院报告：提交书面说明，解释出租原因（如维持厂房价值）、资金用途（如支付员工工资），并配合法院调查，争取从轻处理。

3. 程序补救：通过法律程序化解危机

• 申请解封或置换担保：若查封导致厂房闲置，可向法院申请解封（需提供等值担保）或置换查封财产（如用其他资产替换），以合法方式盘活资产。
• 与承租人协商：签订补充协议，明确租金用于偿还债务或法院指定用途，避免合同无效风险。
• 配合执行程序：若厂房已进入拍卖程序，可申请参与分配或提出执行异议，保障合法权益。

4. 风险防范：未来合规建议

• 查封期间管理：查封后应立即停止经营行为，如需维护资产，可与法院沟通指定管理人。
• 资金监管：所有收入应汇入法院监管账户，避免个人账户接收。
• 法律顾问介入：在查封、出租等重大决策前，咨询律师评估风险，制定合规方案。

若您已涉及此类行为，建议立即整理相关合同、转账记录等证据，并向我详细说明情况（如查封原因、账户性质等），我将为您制定具体应对策略。