你可以基于公司查员工微信流水这一行为选择辞职，但需根据具体情况判断是否合法及是否应获得经济补偿。以下从不同角度为你详细分析：
一、公司查员工微信流水是否合法
隐私权保护：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。微信流水属于个人隐私信息，公司未经员工同意擅自查询，可能构成对员工隐私权的侵犯。
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定了可以查询员工微信流水，并且该规章制度已经过民主程序制定、公示且不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能在一定程度上有权进行查询。但即便如此，也应尊重员工的合理隐私期待，避免过度侵入。
合法性判断：
- 一般情况下，公司无权直接查询员工的微信流水。如果公司以此为由要求员工提供或进行查询，员工有权拒绝。若公司因此采取不利措施（如解雇、降薪等），员工可能通过法律途径维护自身权益。
二、员工是否可以因此辞职
辞职权利：
- 员工享有辞职的权利，这是劳动法赋予的基本权利之一。员工可以基于任何原因（包括对公司行为的不满）提出辞职。
经济补偿：
- 如果员工因公司侵犯其隐私权（如擅自查询微信流水）而辞职，且能证明该行为是导致其辞职的直接原因，那么根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工可能有权要求公司支付经济补偿。但具体是否获得补偿及补偿金额，需根据实际情况和法律规定进行判断。
辞职程序：
- 员工在辞职时，应按照公司规定的程序进行，如提前通知、办理工作交接等。同时，建议员工在辞职时明确说明辞职原因，并保留相关证据，以备后续维权之需。
三、建议与措施
与公司沟通：
- 如果员工对公司查询微信流水的行为感到不满，首先可以尝试与公司进行沟通，表达自己的关切和不满，并寻求解决方案。
收集证据：
- 如果沟通无果，员工应收集相关证据（如公司查询微信流水的记录、公司规章制度等），以备后续维权之需。
寻求法律帮助：
- 如果员工认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律帮助，如咨询专业律师或向劳动监察部门投诉。
谨慎辞职：
- 在决定辞职前，员工应谨慎考虑辞职的后果，包括是否可能获得经济补偿、是否会影响未来的职业发展等。
如有进一步疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。