检察院不会仅因对方存在旧伤就否定轻伤二级的鉴定结果，但会对鉴定意见进行全面实质性审查，以排除旧伤对本次伤情鉴定的影响。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、检察院对鉴定意见的审查程序
在办理故意伤害等案件时，检察院会对鉴定意见进行从程序到实体的全方位审查。这包括：
- 程序性审查：审查是否有委托鉴定手续，鉴定机构、鉴定人是否具备鉴定资质，鉴定程序是否合法。
- 实体性审查：审查鉴定意见中受伤部位、伤口形态与被害人陈述、相关的病历资料等是否吻合。在涉及旧伤的情况下，检察院会特别关注鉴定意见是否排除了旧伤对本次伤情鉴定的影响。
二、旧伤对伤情鉴定的影响及排除方法
如果对方存在旧伤，这可能会对本次伤情的鉴定产生一定影响。但检察院会通过以下方式排除旧伤的影响：
- 调取就诊材料：检察院会调取伤者的旧伤资料，与本次病历材料、X线片等进行仔细比对，以判断本次伤情是否与旧伤有关。
- 委托专业鉴定机构进行补充鉴定：在必要时，检察院会要求公安机关委托专业鉴定机构针对伤情的成伤原因进行补充鉴定，以明确本次伤情是否由新的伤害行为导致。
三、检察院的可能处理方式
- 如果鉴定意见排除了旧伤的影响：且其他证据也支持轻伤二级的鉴定结果，那么检察院会认可该鉴定结果，并据此对犯罪嫌疑人进行指控。
- 如果鉴定意见无法排除旧伤的影响：或者存在其他合理怀疑，那么检察院可能会要求重新鉴定或者不采纳该鉴定结果。在这种情况下，检察院需要进一步收集证据，以查明案件事实。
四、法律建议
- 对于犯罪嫌疑人而言：如果认为鉴定意见存在错误或者不合理之处，可以及时向检察院提出异议，并申请重新鉴定。同时，也可以积极收集证据，以证明自己的清白或者减轻自己的责任。
- 对于被害人而言：如果认为自己的伤情被低估或者忽视，也可以向检察院提出异议，并要求进行更详细的鉴定。同时，保留好相关证据，如医疗记录、照片等，以便在需要时提供证明。
举例说明：
假设在一起故意伤害案件中，被害人之前左手受过伤，但本次冲突中其右手受伤并鉴定为轻伤二级。在这种情况下，检察院会重点审查右手伤情的鉴定意见，并排除左手旧伤对本次鉴定的影响。如果鉴定意见明确且合理，检察院会认可该结果；如果存在疑问或者不合理之处，检察院会要求重新鉴定或者不采纳该结果。
总结与延伸思考：
在涉及旧伤的伤情鉴定案件中，检察院会进行全面实质性审查，以确保鉴定结果的准确性和公正性。因此，犯罪嫌疑人和被害人都应积极配合检察院的调查工作，并提供相关证据以支持自己的主张。如果对鉴定结果有异议，可以及时向检察院提出并申请重新鉴定。