赔偿协议中可以明确写着乙方向甲方要补偿款两万五，但需确保协议内容合法、条款明确且双方意思表示真实。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议内容的合法性

1. 不违反法律法规：赔偿协议的内容必须遵守国家法律法规，不得包含违法或违反公序良俗的条款。例如，不能约定通过非法手段获取补偿款。

2. 不损害第三方利益：协议内容不得损害国家、集体或第三人的利益。如果协议中的补偿款涉及第三方权益，应确保已获得第三方的同意或授权。

二、条款的明确性

1. 补偿款金额明确：在赔偿协议中，应明确写明补偿款的具体金额，如“乙方向甲方要补偿款两万五”。这样有助于避免后续因金额不明而产生的纠纷。

2. 支付方式与期限：除了金额外，协议还应明确补偿款的支付方式（如一次性支付或分期支付）和支付期限。这有助于确保双方按照约定履行义务。

三、双方意思表示的真实性

1. 自愿签订：赔偿协议必须是双方自愿签订的，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方在签订协议时受到欺诈或胁迫，该协议可能被认定为无效或可撤销。

2. 意思表示一致：双方在签订协议时，应对协议内容达成一致意见。如果存在误解或歧义，应及时沟通并明确，以确保协议的有效性和可执行性。

四、法律建议与预防措施

1. 咨询专业律师：在签订赔偿协议前，建议双方咨询专业律师，以确保协议内容合法、条款明确且双方意思表示真实。律师可以提供专业的法律意见和帮助，降低法律风险。

2. 留存相关证据：在签订协议过程中，双方应留存与协议相关的所有证据，如沟通记录、授权委托书等。这些证据在发生纠纷时将有助于证明双方的实际意思表示和协议内容。

3. 明确争议解决方式：在协议中明确约定争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。这样有助于在发生争议时能够及时、有效地解决。

举例说明：假设甲方因乙方的原因遭受了损失，双方经过协商达成一致，愿意签订赔偿协议。在协议中，可以明确写明“乙方向甲方支付补偿款人民币两万五千元整，该款项应于本协议签订之日起三十日内一次性支付至甲方指定账户”。这样的条款既明确了补偿款金额，又规定了支付方式和期限，有助于确保协议的有效执行。