当公司股东发生变故时，处理方式主要取决于变故的性质以及公司的类型（如有限责任公司或股份有限公司），同时需遵循相关法律法规，特别是新《公司法》的相关规定。以下是一些一般性的处理步骤和建议：
一、股东变故类型及初步处理
股东继承：
- 若股东去世，其股权可依法继承。对于股份有限公司，由于不登记具体股东，只登记发起人，最新股东情况可通过企业章程修正案进行备案，并在外网申报时更新相关信息。
- 对于有限责任公司，继承人需按照公司章程或相关法律规定，办理股权变更登记手续，包括提供继承证明、股权转让协议等材料，并可能需要缴纳一定的费用（具体依据当地政策）。
股东转让股权：
- 股东之间或股东向非股东转让股权时，应签订书面股权转让协议，并书面通知公司请求变更股东名册。
- 根据新《公司法》第八十六条，受让人自记载于股东名册时起可以向公司主张行使股东权利。因此，及时更新股东名册是关键。
- 若需办理变更登记，公司应向公司登记机关申请，确保公司登记信息的准确性。
二、具体处理流程（以有限责任公司为例）
签订股权转让协议：
- 转让人与受让人应签订详细的股权转让协议，明确转让价格、支付方式、股权变更时间等关键条款。
通知公司并请求变更股东名册：
- 转让人应书面通知公司股权转让事宜，并请求公司变更股东名册，将受让人记载为新股东。
办理变更登记：
- 若公司章程或相关法律法规要求办理变更登记，公司应向公司登记机关提交相关材料，包括股权转让协议、股东会决议（如适用）、变更登记申请书等。
- 变更登记完成后，公司应注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并修改公司章程中有关股东及其出资额的记载。
处理瑕疵出资情况：
- 若转让的股权存在瑕疵出资（如未足额缴纳出资），根据新《公司法》第八十八条，受让人需承担缴纳该出资的义务。若受让人未按期足额缴纳，转让人需承担补充责任。
- 因此，在股权转让前，受让人应做好尽职调查，确认转让方已全面履行出资义务。
三、注意事项及建议
遵循法律法规：
- 在处理股东变故时，务必遵循新《公司法》及其他相关法律法规的规定，确保处理过程的合法性和有效性。
及时更新公司记录：
- 无论是股东继承还是股权转让，都应及时更新公司股东名册、公司章程等记录，确保公司信息的准确性和完整性。
咨询专业人士：
- 若对处理流程或法律法规存在疑问，建议咨询专业律师或会计师，以获取更具体、更专业的指导。
保持沟通透明：
- 在处理股东变故过程中，应保持与公司其他股东、管理层及员工的沟通透明，确保公司运营的稳定性和连续性。
综上所述，当公司股东发生变故时，应根据变故类型和公司类型采取相应的处理措施，并遵循相关法律法规的规定。通过及时更新公司记录、咨询专业人士和保持沟通透明，可以确保处理过程的顺利进行和公司运营的稳定性。