若公司指使员工犯罪，涉及到的赔偿问题需从刑事责任赔偿和民事责任赔偿两个主要角度分析，具体如下：

1. 刑事责任赔偿

• 核心结论：公司指使员工犯罪，可能构成共同犯罪，公司和员工均需承担刑事责任，赔偿部分通常通过刑事附带民事诉讼解决。
• 具体分析：
  • 共同犯罪认定：根据《刑法》第二十五条，公司指使员工犯罪的，公司与员工构成共同犯罪。公司作为教唆犯或组织犯，需对犯罪结果承担刑事责任。
  • 刑事附带民事诉讼：受害方可在刑事诉讼过程中提起附带民事诉讼，要求公司赔偿因犯罪行为造成的直接经济损失（如财产损失、医疗费用等）。赔偿范围以实际损失为限，需提供相关证据（如发票、鉴定报告等）。
  • 罚金与没收财产：若公司被判处罚金或没收财产，其财产可能优先用于赔偿受害方，但需注意罚金与民事赔偿是独立责任，罚金不直接抵扣民事赔偿。

2. 民事责任赔偿

• 核心结论：即使公司未被追究刑事责任，受害方仍可单独提起民事诉讼，要求公司承担侵权赔偿责任。
• 具体分析：
  • 侵权责任构成：根据《民法典》第一千一百六十五条，公司指使员工实施侵权行为（如故意损害财物、人身伤害等），需承担连带赔偿责任。受害方需证明公司存在过错（如指使行为）与损害结果之间的因果关系。
  • 赔偿范围：包括直接损失（如财产修复费用、医疗费）和间接损失（如误工费、残疾赔偿金）。若员工无财产或财产不足，公司需承担补充赔偿责任。
  • 举证责任：受害方需提供证据证明公司指使行为（如书面指令、录音、证人证言等）。若证据不足，可能面临败诉风险。

3. 特殊情形：单位犯罪

• 核心结论：若公司行为构成单位犯罪（如非法经营、污染环境等），公司需承担罚金，同时可能被责令赔偿社会公共利益损失。
• 具体分析：
  • 单位犯罪认定：根据《刑法》第三十条，公司、企业等单位实施犯罪的，构成单位犯罪。此时，公司需缴纳罚金，直接负责的主管人员和其他直接责任人员也需承担刑事责任。
  • 公益诉讼赔偿：若犯罪行为损害社会公共利益（如环境污染），检察机关或相关组织可提起公益诉讼，要求公司赔偿生态修复费用等。

4. 实务建议

• 及时取证：受害方应尽快固定证据（如犯罪现场照片、聊天记录、转账记录等），避免证据灭失。
• 刑事报案与民事起诉并行：建议同时向公安机关报案（追究刑事责任）和向法院提起民事诉讼（要求赔偿），以提高维权效率。
• 注意诉讼时效：民事赔偿诉讼时效为三年，自知道或应当知道权利受损之日起计算，逾期可能丧失胜诉权。

总结：公司指使员工犯罪的赔偿问题需结合刑事与民事程序处理。受害方可通过刑事附带民事诉讼或单独民事诉讼主张赔偿，同时需关注单位犯罪的特殊情形。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我将结合证据和法律提供详细方案。