结论：存货亏损若已获保险全额赔偿，一般情况下仍需要申报资产损失，但具体处理方式会因企业所得税处理和会计核算的不同要求而有所差异。以下是详细分析：

1. 企业所得税处理角度
   根据《企业资产损失所得税税前扣除管理办法》（国家税务总局公告2011年第25号），企业发生的资产损失，无论是否通过保险赔偿，均需按规定的程序和要求向税务机关申报扣除。

   • 申报必要性：即使保险全额赔偿，企业仍需将存货亏损作为资产损失进行申报，因为保险赔偿属于税后补偿，不影响资产损失本身的税前扣除资格。
     
   • 申报方式：企业需准备相关证据（如存货盘点表、保险理赔协议、损失原因证明等），通过企业所得税年度汇算清缴时填报《资产损失税前扣除及纳税调整明细表》进行申报。
     
   • 特殊情况：若保险赔偿金额超过资产计税基础（如存货账面价值加相关税费），超出部分可能需计入应税收入，但申报资产损失的流程仍需完成。

2. 会计核算角度
   根据《企业会计准则》，存货亏损的会计处理需分两步：

   • 确认损失：将存货账面价值转入“待处理财产损溢”科目，并计提减值准备（如适用）。
     
   • 保险赔偿处理：收到保险赔偿时，冲减“待处理财产损溢”，差额部分计入“营业外支出”或“其他应收款”。
     
   • 申报关联：会计核算中的损失确认是税务申报的基础，即使保险全额赔偿，会计上仍需完整反映损失流程，以确保税务与会计处理的一致性。

3. 实务建议

   • 资料留存：妥善保管存货购入发票、保险合同、理赔单据、损失原因证明等材料，以备税务机关核查。
     
   • 政策更新：关注地方税务机关对资产损失申报的具体要求（如是否需专项审计），避免因程序瑕疵导致扣除被否。
     
   • 沟通协调：若对申报流程存疑，可主动与主管税务机关沟通，明确操作细节。

总结：保险全额赔偿不免除企业申报资产损失的义务，但申报后可通过保险赔偿冲减实际税前扣除金额。建议企业严格按照税法与会计准则要求处理，避免税务风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询。