当您作为农民工被拖欠工资超过三个月时，您可以按照以下步骤来处理这个问题，以维护自己的合法权益：

一、与用人单位协商

首先，您可以尝试与用人单位进行协商，明确表达您要求支付工资的诉求。在协商过程中，建议您保留好相关的聊天记录、通话录音等证据，以备后续需要。

二、向劳动监察部门投诉

如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉。在投诉时，您需要准备好以下材料来证明劳动关系和工资拖欠的事实：

• 劳动合同或工作证
• 考勤记录
• 工资条或银行转账记录等能证明工资未支付的证据

劳动监察部门有权对用人单位进行调查和处罚，并责令其支付拖欠的工资。

三、申请劳动仲裁

如果投诉后问题仍未得到解决，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，您需要在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内向仲裁委提出书面申请。在申请仲裁时，您需要提交仲裁申请书及相关证据材料。

四、提起诉讼

如果您对仲裁结果不服，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。通过法律途径，您可以进一步维护自己的合法权益。

五、其他途径

除了上述途径外，您还可以考虑以下方式：

• 向当地劳动争议调解组织申请调解：如果达成调解协议后用人单位不履行，您可以再申请仲裁。
• 申请支付令：如果您有工资欠条，可以直接向法院申请支付令。法院会根据情况发出支付令，如果用人单位不提出书面异议又不履行，您可以申请强制执行。
• 借助工会组织或法律援助：您可以寻求工会组织的帮助来维护自己的权益，或者申请法律援助来获得专业的法律支持。

六、注意事项

• 在处理过程中，请保持冷静和理性，避免采取过激行为。
• 确保您提供的所有证据都是真实、合法且有效的。
• 及时关注处理进度，并与相关部门保持沟通。

希望以上建议能够帮助您解决被拖欠工资的问题。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，建议及时咨询专业的法律人士或相关部门以获取更具体的指导和帮助。