合同违约后再签补充协议，在符合法定条件的情况下是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、补充协议有效的条件
主体资格合法：
- 签订补充协议的双方当事人都应具备相应的民事行为能力。若一方主体资格不合法，如被吊销营业执照或不具备完全民事行为能力，则所签补充协议可能会被认定无效。
意思表示真实：
- 补充协议的内容必须反映双方当事人的真实意愿，不存在欺诈、胁迫或重大误解等情形。双方应在平等、自愿的基础上进行协商，并达成一致意见。
内容合法合规：
- 补充协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，约定的违约责任不得过于苛刻或显失公平，且不能约定进行违法违规的活动。
形式要件完备：
- 补充协议应明确约定其是对原合同的补充或变更，并注明主合同的内容或将主合同作为附件。同时，应明确约定当补充协议与原合同不一致或发生冲突时，以补充协议为准。此外，补充协议还应写明签订日期，并由双方当事人签字、盖章。
二、补充协议可能无效的情形
以合法形式掩盖非法目的：
- 如果双方签订补充协议的目的是为了掩盖如偷工减料、行贿等违法行为，则该补充协议将被认定为无效。
恶意串通损害他人利益：
- 若双方当事人恶意串通，通过补充协议损害国家、集体或第三人的利益，该协议同样会被认定为无效。例如，通过虚报价格、转移资产等方式损害债权人利益的行为就是无效的。
其他法定无效情形：
- 包括一方以欺诈、胁迫手段订立合同损害国家利益；损害社会公共利益；以及违反法律、行政法规的其他强制性规定等情形。这些情形都可能导致补充协议无效。
三、补充协议与违约责任的关系
- 签订补充协议并不当然免除违约方的违约责任。除非法律有明确规定或当事人之间有特别约定，否则违约方仍需承担因其违约行为给对方造成的损失。
- 守约方有权要求违约方继续履行补充协议并承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。如果违约方拒不履行或无法履行补充协议，守约方还可以通过法律途径追究其法律责任。
四、实际操作建议
- 在签订补充协议前，双方应充分沟通并明确各自的权利和义务，确保协议内容真实、合法、有效。
- 补充协议应尽量明确、具体，避免模糊不清或产生歧义。对于关键条款，如违约责任、争议解决方式等，应进行详细约定。
- 在签订补充协议时，双方应仔细审查协议内容，确保没有遗漏或错误。如有必要，可以请专业律师进行审查或提供法律意见。
- 如果发生争议或纠纷，双方应首先通过友好协商解决。如果协商不成，可以依据补充协议中的争议解决方式（如仲裁或诉讼）进行解决。
总结来看，合同违约后再签补充协议在符合法定条件的情况下是有效的。双方在签订补充协议时应确保主体资格合法、意思表示真实、内容合法合规以及形式要件完备。同时，应明确补充协议与违约责任的关系，并在实际操作中遵循相关建议以确保协议的有效性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。