针对您提出的“民间借款案件法院判决三年了，同一笔账可不可以三年后再起诉”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，如果认为有错误，确实有权向上一级人民法院申请再审。但是，这一申请必须在判决、裁定发生法律效力后的六个月内提出，这是一般规定下的时间限制。
现在，您的案件判决已经生效三年，从时间上来看，如果不存在任何特殊情形，那么您的再审申请通常会因超出这六个月的一般期限而被法院拒绝受理。不过，法律也规定了一些特殊情形，在这些情形下，即使判决已经生效多年，您仍然有权申请再审。
这些特殊情形包括：
发现新的证据：如果您在原审庭审结束后发现了新的证据，且这些证据足以推翻原判决、裁定，那么您可以在知道或应当知道这些新证据之日起六个月内提出再审申请。
原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的：如果您发现原判决、裁定所依据的主要证据是伪造的，同样可以在知道或应当知道该事实之日起六个月内提出再审申请。
据以作出原判决、裁定的法律文书被撤销或者变更：如果原判决、裁定所依据的法律文书后来被撤销或者变更，这也构成了申请再审的特殊情形。
审判人员有违法行为：如果审判人员在审理该案件时有贪污受贿、徇私舞弊、枉法裁判等行为，您同样可以在知道或应当知道该事实之日起六个月内提出再审申请。
然而，即使符合了上述申诉条件，也并不意味着申诉就一定会被法院接受。法院会对申诉进行严格的审查，如果不符合再审条件，会驳回申诉。因此，在决定是否申请再审之前，我建议您先咨询专业的律师，对案件进行全面的评估和分析，以确保申诉的合理性和有效性。
综上所述，民间借贷判决后的申诉是一个复杂且受到严格法律和程序限制的过程。您在面临此类问题时，应及时咨询专业律师，了解自己的权益和可能的申诉途径，以便更好地维护自己的合法权益。