违规招收的学生已经毕业，教育行政部门仍然有权责令退回。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

根据《中华人民共和国教育法》第七十六条的规定，学校或其他教育机构若违反国家有关规定招收学生，教育行政部门或其他有关行政部门有权责令退回招收的学生，并退还所收费用。这一规定并未将学生是否毕业作为是否责令退回的考量因素，因此，即使学生已经毕业，教育行政部门仍可依据此条款责令退回。

行政处罚的时效性

从行政处罚的时效性角度来看，虽然《中华人民共和国行政处罚法》规定了行政处罚的追责时效，但这主要针对的是违法行为发生后至行政机关发现并处罚的时间间隔。对于违规招收学生的行为，只要教育行政部门在发现后依法进行立案、调查、审查等程序，并作出行政处罚决定，就不受学生是否毕业的影响。

实际操作中的考虑

在实际操作中，责令已毕业的学生退回可能面临一些实际困难，如学生已离开原学校、新的学习或工作安排等。然而，这并不影响教育行政部门依法行使职权。教育行政部门在作出责令退回的决定时，会综合考虑各种因素，包括学生的实际情况、学校的违规程度以及社会影响等，以确保决定的合理性和可行性。

可能的法律后果

若学校或其他教育机构未按照教育行政部门的决定退回违规招收的学生，可能会面临更严重的法律后果，如被警告、处以违法所得五倍以下的罚款，甚至被责令停止相关招生资格一年以上三年以下，直至撤销招生资格、吊销办学许可证。同时，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，也会依法给予处分；构成犯罪的，还会依法追究刑事责任。

建议

对于学校或其他教育机构而言，应严格遵守国家有关规定，规范招生行为，避免违规招收学生。若已发生违规行为，应积极配合教育行政部门的调查和处理，主动退回违规招收的学生，并退还所收费用，以减轻可能的法律后果。

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