被人打了两天后住院起诉，证据仍然是有效的。以下从几个关键角度为您详细分析：
一、证据的有效性
就医记录作为证据：
- 即便是在被打两天后住院，您的就医记录，包括诊断记录、检查报告等，仍然可以作为证明伤害事实及程度的证据。这些记录能够客观反映您的伤情，是追究对方责任的重要依据。
报警与证据固定：
- 报警后，警方会展开调查，并结合医院诊断记录来判断责任。只要能够证明打架行为与住院之间的因果关系，您的报警就是有效的。警方会依法受理并处理此类案件。
二、法律程序与期限
报警期限：
- 我国法律并未规定打架后报警的具体时限。但依据《治安管理处罚法》的相关规定，违反治安管理行为在6个月内没有被公安机关发现的，将不再处罚。这一期限是从违反治安管理行为发生之日起计算。因此，只要打架行为发生在6个月内，您报警都是有效的。
诉讼时效：
- 如果涉及民事赔偿或刑事诉讼，您需要注意诉讼时效的问题。一般来说，人身伤害赔偿的诉讼时效为三年，自知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，在两年后起诉，只要仍在诉讼时效期内，您的起诉就是有效的。
三、实际操作建议
及时报警与就医：
- 尽管两天后住院报警和起诉仍然有效，但建议您在遭受伤害后尽快报警并前往医院就医。这样可以及时固定证据，避免因时间间隔过久导致伤情变化影响责任认定。
保留相关证据：
- 在就医过程中，务必保留好所有相关的医疗记录、费用单据等证据。这些证据在后续的报警、调解或诉讼过程中都将发挥重要作用。
寻求法律帮助：
- 如果您对法律程序不熟悉或担心自己的权益得不到保障，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、代理诉讼等服务，确保您的权益得到有效维护。
举例说明：假设小张在周一被小李殴打，当时未立即就医，而是在周三才前往医院检查治疗。医院出具了诊断记录和检查报告，证明小张的伤情。小张随后报警并要求追究小李的责任。尽管小张是在被打两天后住院报警，但只要他能够证明打架行为与住院之间的因果关系，并且报警行为发生在违反治安管理行为发生后的6个月内，那么他的报警和起诉就是有效的。
总结与建议：被人打了两天后住院起诉，证据仍然是有效的。但为了确保权益得到最大保障，建议您尽快报警并就医，同时保留好所有相关证据。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。