针对您提出的“车上卷烟超出5万元怎么处罚”的问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，需要明确的是，对于无烟草专卖品准运证或超过准运证规定数量托运、自运烟草专卖品的行为，烟草专卖行政主管部门会依法进行处罚。当车上卷烟的价值超出5万元时，处罚措施通常更为严厉，但具体处罚仍会依据违法情节的严重程度来判定。
一、行政处罚措施
罚款：
- 根据违法情节，罚款金额通常为违法运输的烟草专卖品价值的20%至50%。对于超出5万元价值的卷烟，罚款比例可能会相应提高，以体现对严重违法行为的惩处。
没收违法所得：
- 烟草专卖行政主管部门有权没收因违法运输烟草专卖品所获得的全部收入，这是剥夺违法行为人经济利益的重要手段。
收购烟草专卖品：
- 在某些情况下，烟草专卖行政主管部门可能会按照查获地省级烟草专卖行政主管部门出具的价格标准，收购违法运输的烟草专卖品。这一措施旨在减少浪费，并促使违法者承担经济后果。
二、特殊情形下的处理
情节特别严重：
- 若超出5万元价值的卷烟运输行为存在多次违法、抗拒检查、利用伪装或特种车辆逃避检查等严重情节，处罚将更加严厉。这可能包括更高的罚款比例、全额没收违法运输的烟草专卖品，以及可能的刑事责任追究。
超限量邮寄或异地携带的延伸处理：
- 虽然个人邮寄、异地携带烟叶、烟草制品的限量规定（如国产烟10条、进口烟5条）主要针对未超5万元价值的情况，但超出此限量且价值较大的运输行为，同样会面临严厉的处罚，包括没收和罚款等。
三、刑事责任提示
- 当车上卷烟的价值超出5万元，且存在其他严重情节（如多次非法经营、造成恶劣社会影响等）时，可能触犯非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营罪情节严重的，可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
四、建议与结论
- 鉴于超出5万元价值的卷烟运输行为可能面临的严厉处罚，我建议您严格遵守烟草专卖法律法规，避免进行任何违法运输活动。
- 若您确实需要运输烟草专卖品，请务必办理相关的准运证件，并确保运输数量在准运证规定的范围内。
- 如您对烟草专卖法律法规有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请及时联系当地的烟草专卖行政主管部门或专业律师。
综上所述，车上卷烟超出5万元价值的运输行为将面临严厉的行政处罚，甚至可能触犯刑事法律。因此，请务必遵守相关法律法规，以免承担不必要的法律后果。