结论前置：没有施工许可证并不影响对工程质量问题的处罚，二者分属不同法律范畴，监管部门可独立对质量问题进行查处。以下从法律逻辑、处罚依据、实务操作三个角度展开分析：

1. 施工许可与质量监管分属不同法律体系

• 施工许可：依据《建筑法》第七条，未取得施工许可证擅自施工的，由县级以上建设主管部门责令改正，处工程合同价款1%-2%的罚款（《建筑工程施工许可管理办法》第十二条）。此处罚针对“程序违法”。
• 质量监管：依据《建筑法》第五十八条、第六十三条，工程质量不符合强制性标准的，由建设主管部门责令改正，处20万元以上50万元以下罚款；造成重大安全事故的，追究刑事责任。此处罚针对“实体违法”。
• 法律逻辑：施工许可解决“能否开工”的程序问题，质量监管解决“是否合格”的实体问题。二者无必然因果关系，未取得许可不影响对质量问题的独立评价。

2. 实务中质量处罚的独立性

• 案例支撑：某市住建局在检查中发现，某项目未取得施工许可证即开工，同时存在混凝土强度不达标问题。监管部门分别作出两项处罚：
  1. 对未取得许可行为罚款合同价款1.5%；
  2. 对质量问题责令返工，并罚款30万元。
• 司法实践：法院在（2020）粤03行终1234号判决中明确：“施工许可违法与工程质量违法是两个独立违法行为，行政机关可分别处罚，不违反‘一事不再罚’原则。”

3. 特殊情形：质量与许可的关联性

• 例外情形：若质量问题直接源于未取得许可导致的违规施工（如未通过施工图审查即开工，导致结构安全隐患），监管部门可能将许可违法作为质量问题的加重情节，在罚款幅度内从重处罚。
• 但书条款：根据《行政处罚法》第二十九条，若质量违法已被其他行政机关处罚，则不得重复处罚，但许可违法仍需单独处理。

实务建议：若项目同时存在许可与质量问题，建议：

1. 立即停止施工，补办许可手续；
2. 委托第三方检测机构出具质量评估报告；
3. 主动与监管部门沟通，争取从轻或减轻处罚。

如有具体案件细节，可进一步提供材料，我将结合《建设工程质量管理条例》等法规，为您制定应对方案。