关于二次鉴定中员工差旅费的承担问题，结论如下：

1. 若二次鉴定由用人单位申请或因用人单位原因导致：

   • 根据《工伤保险条例》及相关司法实践，若二次鉴定系用人单位对初次鉴定结果有异议而申请，或因用人单位未依法缴纳工伤保险、未及时申报工伤等过错导致需要二次鉴定，由此产生的差旅费（包括交通费、住宿费、伙食补助费等）原则上应由用人单位承担。这是因为用人单位的行为直接导致了额外鉴定程序的启动，相关费用应视为其违法或违规行为的成本。

2. 若二次鉴定由员工申请且非因用人单位过错导致：

   • 若二次鉴定系员工对初次鉴定结果不满而自行申请，且该申请并非基于用人单位的过错（如用人单位已依法履行工伤保险义务、初次鉴定程序合法等），则差旅费的承担需分情况讨论：
     • 若员工胜诉（即二次鉴定结果改变了初次鉴定结论，且对员工有利）：根据公平原则，部分法院可能支持由用人单位承担部分或全部差旅费，但这一做法并非全国统一，需结合具体案情和地方司法实践判断。
     • 若员工未胜诉（即二次鉴定结果未改变初次鉴定结论，或对员工不利）：则差旅费通常应由员工自行承担，因为员工作为鉴定申请方，需自行承担申请行为可能带来的风险和成本。

3. 特殊情形下的费用分担：

   • 若双方对二次鉴定均有责任（如用人单位未完全履行义务，但员工申请鉴定也存在不合理之处），法院可能根据双方过错程度，按比例分担差旅费。
   • 若地方性法规或政策对二次鉴定费用有特别规定（如某些地区规定工伤保险基金可承担部分二次鉴定费用），则应优先适用地方规定。

法律建议：

• 对于用人单位而言，应依法履行工伤保险义务，避免因自身过错导致二次鉴定，从而减少不必要的费用支出。
• 对于员工而言，在申请二次鉴定前，应充分评估申请的必要性和合理性，避免因盲目申请而承担不必要的费用。
• 若双方对差旅费承担有争议，建议通过协商、调解或诉讼等方式解决，并保留好相关证据（如鉴定申请书、差旅费票据等）。

可能后果：

• 若用人单位未依法承担应由其承担的差旅费，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付相关费用。
• 若员工无正当理由坚持要求用人单位承担不应由其承担的差旅费，可能面临仲裁或诉讼败诉的风险。

如有具体案情或地方政策疑问，可直接向我咨询，我会结合实际情况为您提供更详细的法律分析。