土方工程是否由甲方签合同，需根据具体工程模式与合同安排来确定，无法一概而论。以下从不同角度进行分析：
EPC总承包模式：
- 在EPC（设计-采购-施工）总承包模式下，甲方通常与总承包方签订一份总承包合同，涵盖设计、采购、施工等全部环节。土方工程作为施工的一部分，一般由总承包方负责，并包含在总承包合同中。此时，甲方并不直接与土方施工单位签订合同。
施工总承包模式：
- 在施工总承包模式下，甲方可能先与施工总承包方签订总承包合同，再由施工总承包方与土方等分包单位签订分包合同。这种情况下，甲方也不直接与土方施工单位签订合同，但甲方对分包合同有监督权。
- 若甲方选择直接发包土方工程，即不通过施工总承包方，而是直接与土方施工单位签订合同，则此时甲方会直接签合同。但这种情况相对较少，且需符合相关法律法规和招标投标程序。
平行发包模式：
- 在平行发包模式下，甲方可能将工程划分为多个标段，分别与不同的施工单位签订合同。若土方工程被划分为一个独立标段，则甲方会直接与土方施工单位签订合同。
其他特殊情况：
- 除了上述常见模式外，还可能存在一些特殊情况。例如，甲方可能因特定需求（如紧急抢修、特殊地质条件处理等）而直接与土方施工单位签订临时合同。
- 另外，若甲方与土方施工单位存在长期合作关系或战略联盟关系，也可能直接签订长期合作合同。
法律建议：
- 在签订土方工程合同时，无论甲方还是乙方，都应明确合同主体、工程范围、质量标准、工期要求、价款支付等关键条款，以避免后续纠纷。
- 甲方在签订合同时，应特别注意对分包单位的监督和管理，确保分包工程的质量和进度符合总承包合同的要求。
- 若涉及直接发包或特殊情况下的合同签订，甲方应确保符合相关法律法规和招标投标程序，避免违法违规行为。
可能法律后果：
- 若甲方未按照法律法规和合同约定签订土方工程合同，可能面临合同无效、违约赔偿等法律后果。
- 若土方施工单位未按照合同约定履行义务，甲方有权要求其承担违约责任，并可能通过法律途径追究其责任。
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