若新三板公司摘牌而小股东不同意，小股东的处理方式需视具体情况而定。以下是从不同角度给出的详细分析：
一、公司未破产的情况
股份自由处置：
- 在新三板市场退市的情况下，若公司并未宣告破产，原有股东将继续持有其所持有的股份份额。小股东可以根据原先订立的协议，自由决定分享利润或出售股份，而无需负担额外的赔偿责任。
特定契约的赔偿：
- 如果小股东与公司签订了特定的契约条款，且该条款规定了公司在摘牌等特定情况下的赔偿责任，那么公司必须依照合同规定予以实际的经济损失补偿。
二、公司破产的情况
- 无赔偿权利：
- 倘若在退市之后，公司不幸宣布破产，则所有股东，包括小股东，都无法再获得任何形式的赔偿。这是因为破产清算时，公司的资产将优先用于偿还债务，而股东作为公司的所有者，其权益在破产程序中通常处于最后清偿顺序。
三、退市依据与风险警示
退市依据：
- 判定某只股票是否应予退市的主要依据包括净资产严重亏损、年经营收入未能达到千万标准、年度审计报告结果负面或难以给出评判性意见等。这些情况下，股票交易将受到退市风险警示。
风险警示的影响：
- 当股票交易受到退市风险警示时，小股东应密切关注公司的财务状况和经营情况，以便及时作出决策。例如，考虑是否出售股份以避免可能的损失。
四、法律建议与行动指南
审查合同与协议：
- 小股东应仔细审查与公司签订的合同和协议，特别是关于摘牌、破产等特定情况下的权利和义务条款。这有助于明确自己在公司摘牌时的法律地位和权益。
关注公司公告与财务报告：
- 小股东应密切关注公司的公告和财务报告，以便及时了解公司的财务状况和经营情况。这有助于小股东作出明智的决策，如是否继续持有股份或出售股份。
寻求法律援助：
- 如果小股东对公司摘牌的决定有异议，或者认为自己的权益受到了侵害，可以寻求法律援助。作为专业律师，我可以为小股东提供法律咨询和代理服务，帮助小股东维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，新三板公司摘牌时小股东的处理方式需根据具体情况而定。如果小股东对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我将根据小股东的具体情况，提供有针对性的法律建议和解决方案。