职务侵占的违法所得是可以被没收的，且必须依法进行。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。”这一条款明确规定了对于犯罪分子违法所得的处理方式，包括追缴、退赔以及没收等措施。在职务侵占案件中，犯罪嫌疑人的违法所得自然也属于这一范畴，因此可以被依法没收。
二、没收的具体情形
数额巨大且情节严重： 当职务侵占的数额达到巨大标准，且情节严重时，法院在判决时可能会考虑没收犯罪嫌疑人的部分或全部个人财产。这既是对犯罪行为的严厉制裁，也是对被害单位财产损失的补偿。例如，若犯罪嫌疑人利用职务之便，侵占了公司数百万元的资金，且该行为对公司造成了重大损失，那么法院在判决时可能会没收其部分或全部财产。
犯罪嫌疑人拒不退赔： 在职务侵占案件中，如果犯罪嫌疑人拒不退赔违法所得，或者无法退赔（如财产已被挥霍或转移），那么法院在判决时可能会依法没收其剩余财产。这是为了确保被害单位的财产损失得到最大程度的补偿，同时也是对犯罪嫌疑人的一种法律制裁。
三、没收程序的合法性
没收职务侵占的违法所得必须严格依法进行。法院在判决时，会根据案件的具体情况，包括犯罪嫌疑人的犯罪情节、数额大小、退赔情况等因素，综合考量是否没收其财产。同时，没收程序也必须遵循法律规定的步骤和要求，确保不侵犯犯罪嫌疑人的合法权益。例如，在没收前，法院会进行充分的调查和取证工作，确保没收的财物确实属于违法所得；在没收过程中，法院会依法进行公告和听证等程序，确保犯罪嫌疑人的知情权和申辩权得到保障。
四、实际案例与法律后果
在实际案例中，职务侵占的违法所得被没收的情况并不少见。例如，某公司员工利用职务之便，侵占了公司数十万元的资金。在案件审理过程中，该员工拒不退赔违法所得。最终，法院在判决时依法没收了其部分财产，以补偿公司的财产损失。这一案例充分说明了职务侵占的违法所得是可以被没收的，并且这种没收是依法进行的。
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