醉驾案件因执法主体不合法一般不能直接撤案，但执法主体不合法可能成为案件处理中的一个争议点，需通过法定程序来纠正。以下从不同角度为您详细分析：
一、醉驾案件的法律性质与撤案条件
法律性质：醉驾涉嫌危险驾驶罪，是刑事犯罪行为，而非自诉案件。一旦交警在执勤过程中查到车主醉驾，需立即交给公安机关立案，并对当事人采取刑事强制措施，如拘留等。
撤案条件：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，醉驾案件的撤案必须符合严格的法定条件，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等。执法主体不合法并不直接属于这些撤案条件之一。
二、执法主体不合法对案件的影响
程序合法性：如果执法主体在查处醉驾过程中存在不合法行为，如未按规定程序进行血液检测、未出示执法证件等，这可能影响案件的程序合法性。但程序不合法并不直接导致案件撤案，而是可能成为案件处理中的一个争议点。
证据效力：执法主体不合法可能影响所收集证据的效力。如果关键证据因执法主体不合法而被认定为非法取得或存在严重瑕疵，这可能导致案件在侦查阶段被撤销或起诉阶段被不起诉。但这种情况需要充分的证据支持，并且需经过法定程序进行审查和判断。
三、处理执法主体不合法问题的途径
提出异议：如果认为执法主体在查处醉驾过程中存在不合法行为，可以在案件处理过程中提出异议，并要求相关部门进行调查和纠正。
申请复议或诉讼：如果对案件处理结果不满，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，通过法定程序来维护自己的合法权益。
四、实际案例与法律建议
实际案例：在实际操作中，曾有因执法程序不合法而导致案件被撤销的案例。但这些案例通常涉及严重的程序瑕疵或非法取证行为，并且需要充分的证据支持。
法律建议：
总结来说，醉驾案件因执法主体不合法一般不能直接撤案，但执法主体不合法可能成为案件处理中的一个争议点。如果遇到此类问题，建议及时咨询专业律师并了解自己的权利和义务。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。