结论是：在夫妻起诉离婚的过程中，女方通常不能直接要求将男方婚前自建房判一半给两个女儿。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、房产性质与归属
首先，我们需要明确的是，男方在结婚前自建的房屋，通常被视为其个人财产。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一方的婚前财产属于其个人所有，不因婚姻关系的延续而转化为夫妻共同财产。因此，在离婚时，该房产原则上应归男方所有，女方无权直接要求分割。
二、子女抚养与财产分割的区别
在离婚案件中，子女抚养和财产分割是两个独立的法律问题。子女抚养主要关注的是子女的成长环境和利益，而财产分割则关注的是夫妻双方财产的归属和分配。女方要求将男方婚前房产判给子女，实际上是将子女抚养问题与财产分割问题混为一谈。子女并非房产的合法所有者，因此，这种要求在法律上通常是不被支持的。
三、可能的法律途径与限制
虽然女方不能直接要求将男方婚前房产判给子女，但在某些特定情况下，她可能通过其他法律途径来保障子女的利益。例如：
协商与调解：在离婚过程中，双方可以通过协商或调解的方式，就房产的使用、收益或处置等事宜达成协议。如果男方同意将部分或全部房产权益转让给子女，那么这种协议在法律上可能是有效的。但需要注意的是，这种协议必须基于双方自愿和公平的原则，且不得违反法律法规的强制性规定。
设立信托或遗嘱：男方可以通过设立信托或遗嘱的方式，将房产的部分或全部权益指定给子女继承或受益。但这种方式需要在男方生前进行安排，并且受到相关法律法规的限制和约束。
考虑子女的实际需要：在离婚案件中，法院在判决子女抚养权和抚养费时，会综合考虑子女的实际需要、父母的负担能力以及当地的实际生活水平等因素。如果女方能够证明子女需要更多的经济支持，法院可能会在判决抚养费时给予相应的考虑。但这并不意味着子女可以直接获得男方的房产。
四、法律建议与风险提示
对于女方来说，如果希望保障子女的利益，建议采取以下措施：
与男方进行友好协商：尝试通过沟通达成共识，为子女创造一个更好的成长环境。
寻求法律援助或咨询：在离婚过程中，如果遇到法律问题或困惑，可以寻求专业律师的帮助和咨询。律师可以根据具体情况提供法律建议和指导。
关注子女的心理健康和成长需求：离婚对子女来说可能是一个巨大的打击和变化。因此，女方需要特别关注子女的心理健康和成长需求，给予他们足够的关爱和支持。
同时，也需要提醒女方注意以下风险点：
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。